290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0243 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3387  heat shock protein 90  74.46 
 
 		 643 aa  989    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4676  heat shock protein 90  58.97 
 
 		 657 aa  772    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20340  heat shock protein 90  65.9 
 
 		 644 aa  846    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2474  heat shock protein 90  68.22 
 
 		 636 aa  886    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0369006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2392  heat shock protein 90  62.06 
 
 		 646 aa  815    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0243  heat shock protein 90  100 
 
 		 650 aa  1316    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5294  heat shock protein 90  64.62 
 
 		 636 aa  847    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3701  Heat shock protein Hsp90-like protein  56.51 
 
 		 640 aa  700    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93558  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2743  heat shock protein Hsp90  58.08 
 
 		 677 aa  758    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12322  heat shock protein 90  65.03 
 
 		 647 aa  855    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5377  Heat shock protein Hsp90-like protein  52.26 
 
 		 657 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4650  heat shock protein 90  63.23 
 
 		 651 aa  834    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1817  heat shock protein 90  63.38 
 
 		 651 aa  830    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290243  normal  0.0459301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2657  heat shock protein 90  68.68 
 
 		 636 aa  910    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0502417  hitchhiker  0.00031577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  48.92 
 
 		 644 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  47.99 
 
 		 645 aa  596  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  47.43 
 
 		 644 aa  592  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2214  heat shock protein 90  46.47 
 
 		 642 aa  591  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000258546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1803  heat shock protein 90  47.58 
 
 		 644 aa  585  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  47.94 
 
 		 628 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  47.94 
 
 		 628 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1728  heat shock protein 90  47.45 
 
 		 645 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000167687  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1694  heat shock protein 90  47.47 
 
 		 642 aa  580  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000812409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  48.52 
 
 		 650 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2498  heat shock protein 90  48 
 
 		 650 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000559019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  48.92 
 
 		 633 aa  569  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  46.66 
 
 		 634 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  47.34 
 
 		 636 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  47.91 
 
 		 632 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  48.22 
 
 		 632 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  46.89 
 
 		 632 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  47.6 
 
 		 632 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  46.82 
 
 		 630 aa  561  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  47.75 
 
 		 632 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  47.29 
 
 		 632 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  47.29 
 
 		 632 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  47.29 
 
 		 632 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  47.06 
 
 		 634 aa  558  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  47.29 
 
 		 632 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  47.13 
 
 		 632 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  47.91 
 
 		 632 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  47.29 
 
 		 632 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  47.91 
 
 		 632 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  45.85 
 
 		 630 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  47.91 
 
 		 632 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  47.29 
 
 		 632 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  47.44 
 
 		 632 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  47.03 
 
 		 634 aa  549  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  45.72 
 
 		 637 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  46.12 
 
 		 639 aa  548  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  44.55 
 
 		 635 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  47.11 
 
 		 628 aa  548  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  44.95 
 
 		 630 aa  547  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  45.94 
 
 		 633 aa  547  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  44.95 
 
 		 635 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  45.5 
 
 		 634 aa  542  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  43.03 
 
 		 638 aa  544  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  44.77 
 
 		 632 aa  545  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  44.89 
 
 		 634 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  44.12 
 
 		 634 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  44.89 
 
 		 634 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0814  heat shock protein 90  43.63 
 
 		 632 aa  539  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  44.94 
 
 		 634 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  44.27 
 
 		 634 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  44.27 
 
 		 634 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3901  heat shock protein 90  43.49 
 
 		 653 aa  537  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.795746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  45.27 
 
 		 633 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  45.99 
 
 		 629 aa  537  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  45.99 
 
 		 629 aa  537  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1086  heat shock protein 90  42.46 
 
 		 623 aa  535  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2370  heat shock protein 90  44.55 
 
 		 642 aa  535  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0508031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  44.33 
 
 		 634 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2506  heat shock protein 90  45.27 
 
 		 633 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  44.95 
 
 		 626 aa  533  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  46.24 
 
 		 652 aa  533  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1548  heat shock protein 90  45.78 
 
 		 630 aa  533  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00180815  normal  0.134338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  42.64 
 
 		 639 aa  530  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  46.86 
 
 		 640 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  44.17 
 
 		 623 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  44.44 
 
 		 633 aa  530  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  44.38 
 
 		 629 aa  528  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3036  heat shock protein 90  45.37 
 
 		 629 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  42.68 
 
 		 637 aa  531  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  43.54 
 
 		 635 aa  531  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  43.86 
 
 		 623 aa  527  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  44.29 
 
 		 633 aa  527  1e-148  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  44.05 
 
 		 629 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  44.74 
 
 		 624 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  44.74 
 
 		 624 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  42.4 
 
 		 638 aa  525  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  44.74 
 
 		 624 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  44.58 
 
 		 624 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01327  heat shock protein 90  43.7 
 
 		 634 aa  528  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  44.77 
 
 		 624 aa  525  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  44.77 
 
 		 624 aa  525  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  44.77 
 
 		 624 aa  525  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  44.46 
 
 		 647 aa  522  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  44.62 
 
 		 624 aa  522  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1428  heat shock protein 90  42.13 
 
 		 637 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000680402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  44.77 
 
 		 624 aa  525  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>