291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5466 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5466  HSP90 family protein  100 
 
 
585 aa  1152    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4208  ATP-binding region ATPase domain protein  52.36 
 
 
589 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136628  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1831  HSP90 family protein  49.91 
 
 
646 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0495  ATP-binding region ATPase domain protein  50.33 
 
 
598 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0695  HSP90 family protein  45.83 
 
 
643 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2987  ATP-binding region ATPase domain protein  47.25 
 
 
622 aa  455  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23120  molecular chaperone of HSP90 family  42.02 
 
 
641 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.139471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0267  HSP90 family protein  42.61 
 
 
661 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.979719  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1779  ATP-binding region ATPase domain protein  39.14 
 
 
613 aa  396  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2463  HSP90 family protein  35.5 
 
 
621 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0779682  decreased coverage  0.00689697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4284  hypothetical protein  28.37 
 
 
611 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5718  Molecular chaperone HSP90 family-like protein  28.59 
 
 
872 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.903577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01954  Hsp90xo protein  30.1 
 
 
622 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4279  Hsp90xo protein  29.06 
 
 
608 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4376  HSP90 family molecular chaperone-like  27.47 
 
 
838 aa  158  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4377  ATPase domain-containing protein  26.48 
 
 
594 aa  147  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4309  HSP90 family protein  29.48 
 
 
617 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50590  HSP90 family protein  30.21 
 
 
636 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1146  Hsp90xo protein  28.72 
 
 
618 aa  140  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5199  heat shock protein 90  25.33 
 
 
610 aa  137  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661804  normal  0.486638 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1573  heat shock protein 90  23.79 
 
 
628 aa  136  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534584  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08591  heat shock protein 90  26.89 
 
 
632 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.559201  hitchhiker  0.00238922 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09831  heat shock protein 90  25.46 
 
 
634 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0943  heat shock protein 90  24.34 
 
 
603 aa  128  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1800  heat shock protein Hsp90  23.94 
 
 
646 aa  128  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0607  heat shock protein 90  27.99 
 
 
637 aa  128  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2852  heat shock protein 90  28.02 
 
 
669 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1147  heat shock protein 90  27.42 
 
 
636 aa  127  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30595  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0960  heat shock protein 90  30.59 
 
 
626 aa  126  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.515332  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  23.93 
 
 
627 aa  126  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3230  heat shock protein 90  27.49 
 
 
614 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000011209  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1071  heat shock protein 90  22.7 
 
 
629 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0570  heat shock protein 90  21.32 
 
 
616 aa  124  3e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_55215  heat shock protein Hsp90  26.47 
 
 
780 aa  124  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09581  heat shock protein 90  24.14 
 
 
634 aa  124  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09601  heat shock protein 90  24.4 
 
 
634 aa  124  7e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.237308  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0045  heat shock protein 90  25.08 
 
 
684 aa  122  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1117  heat shock protein 90  28.25 
 
 
668 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.775392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20340  heat shock protein 90  28 
 
 
644 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09791  heat shock protein 90  25.2 
 
 
634 aa  123  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.275736 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1404  heat shock protein 90  28.2 
 
 
634 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.898305 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07530  chaperone protein HtpG  25.41 
 
 
633 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.583875  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1459  ATP-binding region ATPase domain protein  25.32 
 
 
610 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  24.64 
 
 
624 aa  121  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0899  heat shock protein 90  24.14 
 
 
634 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.460903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  24.64 
 
 
624 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0019  heat shock protein 90  26.09 
 
 
631 aa  121  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  24.64 
 
 
622 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0306  heat shock protein 90  24.67 
 
 
634 aa  121  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0856617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2376  heat shock protein 90  25.25 
 
 
627 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175392  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1155  heat shock protein 90  29.75 
 
 
626 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1028  heat shock protein 90  29.75 
 
 
626 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162426  normal  0.169491 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15251  heat shock protein 90  27.06 
 
 
636 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0243  heat shock protein 90  27.09 
 
 
650 aa  118  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1472  heat shock protein 90  26.19 
 
 
615 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1273  heat shock protein 90  25.11 
 
 
625 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  23.64 
 
 
629 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1086  heat shock protein 90  25.07 
 
 
623 aa  117  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0550  heat shock protein 90  21.75 
 
 
634 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  32.01 
 
 
611 aa  117  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  32.73 
 
 
610 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0492  heat shock protein 90  22.65 
 
 
634 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0800  heat shock protein 90  23.73 
 
 
633 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  23.85 
 
 
624 aa  116  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2002  heat shock protein 90  27.01 
 
 
613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.240397 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1199  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  27.46 
 
 
652 aa  115  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  24.64 
 
 
624 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  31.5 
 
 
611 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1195  heat shock protein 90  22.71 
 
 
628 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  24.92 
 
 
624 aa  114  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  24.43 
 
 
644 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0752  heat shock protein 90  24.6 
 
 
633 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2005  heat shock protein 90  26.17 
 
 
656 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3489  heat shock protein 90  23.62 
 
 
665 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.179421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2614  heat shock protein 90  23.62 
 
 
665 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  25.36 
 
 
624 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  25.36 
 
 
624 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  25.36 
 
 
624 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  25.36 
 
 
624 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  25 
 
 
623 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2474  heat shock protein 90  26.76 
 
 
636 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0369006  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  25.36 
 
 
624 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  24.49 
 
 
624 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  24.49 
 
 
624 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  24.49 
 
 
624 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6991  heat shock protein Hsp90  25.07 
 
 
611 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  25.36 
 
 
624 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1549  heat shock protein 90  27.21 
 
 
630 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  25.36 
 
 
624 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  25.36 
 
 
624 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0141  heat shock protein 90  25.91 
 
 
658 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0358231  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4673  heat shock protein 90  28.95 
 
 
631 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25549  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1082  heat shock protein 90  27.6 
 
 
634 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1022  heat shock protein 90  24.32 
 
 
629 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  28.65 
 
 
628 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  27.42 
 
 
636 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4168  heat shock protein 90  29.01 
 
 
629 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.160009  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  24.33 
 
 
624 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0117  heat shock protein 90  23.13 
 
 
631 aa  111  4.0000000000000004e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  23.53 
 
 
629 aa  110  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>