289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07530 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0045  heat shock protein 90  49.07 
 
 
684 aa  650    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6991  heat shock protein Hsp90  54.02 
 
 
611 aa  673    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1459  ATP-binding region ATPase domain protein  53.59 
 
 
610 aa  667    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0019  heat shock protein 90  70.84 
 
 
631 aa  894    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5199  heat shock protein 90  53.82 
 
 
610 aa  662    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661804  normal  0.486638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0260  heat shock protein 90  78.99 
 
 
627 aa  997    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.694865  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0051  heat shock protein 90  53.65 
 
 
629 aa  678    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.544882  normal  0.404377 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07530  chaperone protein HtpG  100 
 
 
633 aa  1291    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.583875  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0477  heat shock protein 90  53.33 
 
 
604 aa  635    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.333443  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0943  heat shock protein 90  47.93 
 
 
603 aa  594  1e-168  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1764  heat shock protein 90  42.19 
 
 
615 aa  511  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000444601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3369  heat shock protein 90  41.63 
 
 
677 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000119649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2005  heat shock protein 90  41.06 
 
 
656 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0550  heat shock protein 90  41.35 
 
 
634 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114569  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0492  heat shock protein 90  41.16 
 
 
634 aa  477  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138197  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1813  heat shock protein 90  40.97 
 
 
638 aa  469  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.138988  normal  0.331097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4127  heat shock protein 90  39.91 
 
 
669 aa  467  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745159  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0141  heat shock protein 90  40.26 
 
 
658 aa  465  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0358231  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1199  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  40.12 
 
 
652 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2852  heat shock protein 90  39.86 
 
 
669 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3489  heat shock protein 90  39.54 
 
 
665 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.179421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2614  heat shock protein 90  39.54 
 
 
665 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0306  heat shock protein 90  41.24 
 
 
634 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0856617  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09791  heat shock protein 90  41.24 
 
 
634 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.275736 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08591  heat shock protein 90  39.82 
 
 
632 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.559201  hitchhiker  0.00238922 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1404  heat shock protein 90  36.91 
 
 
634 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.898305 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09831  heat shock protein 90  38.38 
 
 
634 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15251  heat shock protein 90  37.05 
 
 
636 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09581  heat shock protein 90  38.83 
 
 
634 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0899  heat shock protein 90  38.74 
 
 
634 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.460903  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09601  heat shock protein 90  38.83 
 
 
634 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.237308  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1082  heat shock protein 90  36.46 
 
 
634 aa  402  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_55215  heat shock protein Hsp90  30.51 
 
 
780 aa  267  5e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  33.18 
 
 
630 aa  264  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  33.8 
 
 
644 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  31.85 
 
 
624 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  31.85 
 
 
624 aa  258  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  31.85 
 
 
624 aa  258  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  31.85 
 
 
624 aa  258  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  31.85 
 
 
624 aa  258  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  31.85 
 
 
624 aa  258  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  31.85 
 
 
624 aa  258  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  31.85 
 
 
624 aa  258  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  31.85 
 
 
624 aa  257  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01104  heat shock protein 90  30.93 
 
 
640 aa  257  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436583  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2370  heat shock protein 90  33.27 
 
 
642 aa  253  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0508031  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  33.54 
 
 
645 aa  252  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  30.96 
 
 
624 aa  251  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  31.6 
 
 
624 aa  249  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  30.93 
 
 
624 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  33.46 
 
 
624 aa  248  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  33.46 
 
 
624 aa  248  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  30.03 
 
 
637 aa  247  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  33.46 
 
 
624 aa  248  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  33.2 
 
 
644 aa  246  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  33.95 
 
 
650 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  32.09 
 
 
626 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1264  heat shock protein 90  32.08 
 
 
630 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0853768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  29.54 
 
 
637 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000323275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  32.96 
 
 
629 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0856  heat shock protein 90  32.11 
 
 
627 aa  245  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.585619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  29.88 
 
 
637 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3036  heat shock protein 90  32.83 
 
 
629 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2894  heat shock protein 90  30.75 
 
 
640 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.511153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  31.11 
 
 
638 aa  243  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  31.15 
 
 
626 aa  244  5e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  35.86 
 
 
628 aa  243  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  30.39 
 
 
630 aa  243  9e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  30.07 
 
 
637 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1538  heat shock protein 90  31.09 
 
 
637 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0309955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  30.07 
 
 
637 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000082742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1022  heat shock protein 90  33.46 
 
 
629 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2214  heat shock protein 90  31.45 
 
 
642 aa  242  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000258546  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  32.4 
 
 
639 aa  242  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2548  heat shock protein 90  30.07 
 
 
637 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00763476  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1798  heat shock protein 90  30 
 
 
637 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1326  heat shock protein 90  31.86 
 
 
624 aa  241  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2251  heat shock protein 90  29.03 
 
 
637 aa  241  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000711928  normal  0.266626 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2849  heat shock protein 90  30.35 
 
 
638 aa  240  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000520054  decreased coverage  0.00000000518986 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0814  heat shock protein 90  32.84 
 
 
632 aa  240  6.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2323  heat shock protein 90  28.93 
 
 
637 aa  239  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000423215  hitchhiker  0.000689405 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004137  chaperone protein HtpG  34.63 
 
 
634 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  33.69 
 
 
635 aa  239  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  30.3 
 
 
634 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2498  heat shock protein 90  32.7 
 
 
650 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000559019  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01327  heat shock protein 90  33.33 
 
 
634 aa  239  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2443  heat shock protein 90  28.93 
 
 
637 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000425948  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  30.93 
 
 
638 aa  239  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3901  heat shock protein 90  30.14 
 
 
653 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.795746  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  30.19 
 
 
634 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  32.02 
 
 
629 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  29.22 
 
 
635 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  31.69 
 
 
636 aa  237  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  30.19 
 
 
622 aa  237  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  33.27 
 
 
628 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  33.27 
 
 
628 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  34.59 
 
 
634 aa  237  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  30.19 
 
 
624 aa  237  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  28.14 
 
 
632 aa  237  6e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  30.19 
 
 
624 aa  237  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>