288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0477 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0019  heat shock protein 90  54.33 
 
 
631 aa  644    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1459  ATP-binding region ATPase domain protein  63.41 
 
 
610 aa  822    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5199  heat shock protein 90  66.34 
 
 
610 aa  826    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661804  normal  0.486638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0051  heat shock protein 90  62.82 
 
 
629 aa  790    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.544882  normal  0.404377 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0943  heat shock protein 90  57.12 
 
 
603 aa  735    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0477  heat shock protein 90  100 
 
 
604 aa  1238    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.333443  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07530  chaperone protein HtpG  53.33 
 
 
633 aa  643    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.583875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6991  heat shock protein Hsp90  56.31 
 
 
611 aa  698    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854649 
 
 
-
 
NC_002950  PG0045  heat shock protein 90  52.75 
 
 
684 aa  632  1e-180  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0260  heat shock protein 90  52.66 
 
 
627 aa  620  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.694865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1764  heat shock protein 90  45.37 
 
 
615 aa  559  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000444601  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2005  heat shock protein 90  41.96 
 
 
656 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0492  heat shock protein 90  43.72 
 
 
634 aa  531  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138197  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4127  heat shock protein 90  41.95 
 
 
669 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745159  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1199  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  42.27 
 
 
652 aa  520  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1813  heat shock protein 90  42.68 
 
 
638 aa  521  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.138988  normal  0.331097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2852  heat shock protein 90  42.32 
 
 
669 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3489  heat shock protein 90  42.3 
 
 
665 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.179421 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0550  heat shock protein 90  43.89 
 
 
634 aa  512  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114569  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2614  heat shock protein 90  42.3 
 
 
665 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0141  heat shock protein 90  41.96 
 
 
658 aa  513  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0358231  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09791  heat shock protein 90  43.51 
 
 
634 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.275736 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0306  heat shock protein 90  43.19 
 
 
634 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0856617  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15251  heat shock protein 90  40.66 
 
 
636 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3369  heat shock protein 90  40.33 
 
 
677 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000119649  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1404  heat shock protein 90  40.35 
 
 
634 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.898305 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08591  heat shock protein 90  40.54 
 
 
632 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.559201  hitchhiker  0.00238922 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09581  heat shock protein 90  44.83 
 
 
634 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09831  heat shock protein 90  42.03 
 
 
634 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1082  heat shock protein 90  39.94 
 
 
634 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09601  heat shock protein 90  44.48 
 
 
634 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.237308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0899  heat shock protein 90  44.14 
 
 
634 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.460903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2489  heat shock protein 90  30.59 
 
 
628 aa  267  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.356578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4301  heat shock protein 90  29.64 
 
 
627 aa  267  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01104  heat shock protein 90  32.91 
 
 
640 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  33.33 
 
 
634 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  33.33 
 
 
634 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  33.39 
 
 
635 aa  259  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4168  heat shock protein 90  28.69 
 
 
629 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.160009  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1472  heat shock protein 90  30.76 
 
 
615 aa  257  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  32.58 
 
 
634 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  33.23 
 
 
630 aa  256  7e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  31.87 
 
 
624 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  31.87 
 
 
624 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  32.41 
 
 
634 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  31.87 
 
 
624 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  31.87 
 
 
624 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  31.87 
 
 
624 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  32.19 
 
 
626 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  31.87 
 
 
624 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  31.87 
 
 
624 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0956  heat shock protein 90  34.43 
 
 
634 aa  255  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.538924  normal  0.713469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  31.83 
 
 
630 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  32.41 
 
 
634 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  31.06 
 
 
629 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  31.87 
 
 
624 aa  253  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  32.93 
 
 
637 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  31.92 
 
 
624 aa  253  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  32.41 
 
 
635 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  31.87 
 
 
624 aa  252  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0607  heat shock protein 90  31.03 
 
 
637 aa  252  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  31.33 
 
 
628 aa  252  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  31.78 
 
 
624 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  31.78 
 
 
624 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  32.09 
 
 
624 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  32.24 
 
 
624 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  31.34 
 
 
637 aa  251  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  32.01 
 
 
634 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  32.09 
 
 
624 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  32.09 
 
 
624 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  31.78 
 
 
622 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2251  heat shock protein 90  31.03 
 
 
637 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000711928  normal  0.266626 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  31.11 
 
 
638 aa  250  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2894  heat shock protein 90  29.8 
 
 
640 aa  249  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.511153  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1022  heat shock protein 90  30.37 
 
 
629 aa  249  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  33.16 
 
 
634 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  30.85 
 
 
637 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000323275  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  31.87 
 
 
624 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2323  heat shock protein 90  30.88 
 
 
637 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000423215  hitchhiker  0.000689405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2443  heat shock protein 90  31.03 
 
 
637 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000425948  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  30.9 
 
 
638 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  31.17 
 
 
637 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2548  heat shock protein 90  30.96 
 
 
637 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00763476  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  31.72 
 
 
629 aa  248  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  31.5 
 
 
639 aa  248  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  31.72 
 
 
629 aa  248  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  30.98 
 
 
637 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1428  heat shock protein 90  31.55 
 
 
637 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000680402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  30.98 
 
 
637 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000082742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  30.03 
 
 
629 aa  247  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  28.77 
 
 
633 aa  247  4.9999999999999997e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  31.09 
 
 
634 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1798  heat shock protein 90  30.96 
 
 
637 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  32.33 
 
 
634 aa  246  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1548  heat shock protein 90  31.9 
 
 
630 aa  245  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00180815  normal  0.134338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  32.05 
 
 
634 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  33.46 
 
 
623 aa  245  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  30.35 
 
 
632 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1538  heat shock protein 90  33.33 
 
 
637 aa  244  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0309955  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  31.6 
 
 
632 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>