285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0550 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0550  heat shock protein 90  100 
 
 		 634 aa  1290    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3369  heat shock protein 90  50.66 
 
 		 677 aa  681    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000119649  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0492  heat shock protein 90  67.03 
 
 		 634 aa  892    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1764  heat shock protein 90  46.76 
 
 		 615 aa  592  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000444601  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2005  heat shock protein 90  44.94 
 
 		 656 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3489  heat shock protein 90  42.5 
 
 		 665 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.179421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2614  heat shock protein 90  42.5 
 
 		 665 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2852  heat shock protein 90  43.21 
 
 		 669 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1199  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  44.11 
 
 		 652 aa  538  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0141  heat shock protein 90  44.02 
 
 		 658 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0358231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1813  heat shock protein 90  41.45 
 
 		 638 aa  535  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.138988  normal  0.331097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5199  heat shock protein 90  46.37 
 
 		 610 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661804  normal  0.486638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4127  heat shock protein 90  41.55 
 
 		 669 aa  535  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0051  heat shock protein 90  43.11 
 
 		 629 aa  528  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.544882  normal  0.404377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1459  ATP-binding region ATPase domain protein  44.94 
 
 		 610 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0477  heat shock protein 90  43.89 
 
 		 604 aa  503  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.333443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0260  heat shock protein 90  44.08 
 
 		 627 aa  486  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.694865  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15251  heat shock protein 90  39.85 
 
 		 636 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0943  heat shock protein 90  39.78 
 
 		 603 aa  481  1e-134  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0306  heat shock protein 90  40.76 
 
 		 634 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0856617  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09791  heat shock protein 90  40.76 
 
 		 634 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.275736 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0019  heat shock protein 90  42.86 
 
 		 631 aa  481  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6991  heat shock protein Hsp90  41.81 
 
 		 611 aa  475  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854649 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08591  heat shock protein 90  39.2 
 
 		 632 aa  475  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.559201  hitchhiker  0.00238922 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07530  chaperone protein HtpG  41.3 
 
 		 633 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.583875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1404  heat shock protein 90  38.8 
 
 		 634 aa  468  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.898305 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1082  heat shock protein 90  39.11 
 
 		 634 aa  463  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0045  heat shock protein 90  40.61 
 
 		 684 aa  451  1e-125  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09581  heat shock protein 90  38.91 
 
 		 634 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09831  heat shock protein 90  37.44 
 
 		 634 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09601  heat shock protein 90  38.3 
 
 		 634 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.237308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0899  heat shock protein 90  37.5 
 
 		 634 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.460903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0322  heat shock protein 90  27.78 
 
 		 624 aa  288  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1694  heat shock protein 90  36.64 
 
 		 642 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000812409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  28.84 
 
 		 633 aa  278  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  32.1 
 
 		 644 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  29.75 
 
 		 628 aa  276  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  31.6 
 
 		 638 aa  276  9e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  30.31 
 
 		 652 aa  271  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4168  heat shock protein 90  26.92 
 
 		 629 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.160009  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  31.42 
 
 		 639 aa  270  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4301  heat shock protein 90  27.08 
 
 		 627 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01104  heat shock protein 90  29.64 
 
 		 640 aa  270  5.9999999999999995e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436583  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  33.73 
 
 		 624 aa  266  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  33.73 
 
 		 624 aa  266  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  28.72 
 
 		 634 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  32.44 
 
 		 636 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  33.73 
 
 		 624 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  29.07 
 
 		 630 aa  265  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  33.73 
 
 		 624 aa  265  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  33.73 
 
 		 624 aa  266  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  33.73 
 
 		 624 aa  266  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  29.51 
 
 		 634 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  33.73 
 
 		 624 aa  266  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  33.73 
 
 		 624 aa  266  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  33.73 
 
 		 624 aa  266  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  30.31 
 
 		 634 aa  265  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  31.27 
 
 		 635 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  28.72 
 
 		 634 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  28.4 
 
 		 632 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  28.42 
 
 		 632 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  28.12 
 
 		 632 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  29.7 
 
 		 629 aa  263  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  31.09 
 
 		 638 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  30.45 
 
 		 624 aa  262  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2506  heat shock protein 90  29.41 
 
 		 633 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  27.96 
 
 		 632 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  27.96 
 
 		 632 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  30.29 
 
 		 624 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  29.09 
 
 		 635 aa  261  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  28.26 
 
 		 628 aa  261  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  28.26 
 
 		 628 aa  261  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  30.29 
 
 		 624 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  30.29 
 
 		 624 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  30.29 
 
 		 624 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3230  heat shock protein 90  28.93 
 
 		 614 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000011209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  29.27 
 
 		 634 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  29.97 
 
 		 629 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1086  heat shock protein 90  31.18 
 
 		 623 aa  260  6e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  29.94 
 
 		 637 aa  260  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  27.66 
 
 		 632 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1798  heat shock protein 90  30.56 
 
 		 637 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145006 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  28.66 
 
 		 632 aa  259  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  31.41 
 
 		 623 aa  259  9e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  30.25 
 
 		 645 aa  259  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  30.37 
 
 		 637 aa  259  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1022  heat shock protein 90  30.23 
 
 		 629 aa  259  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  28.28 
 
 		 637 aa  259  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  30.56 
 
 		 637 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  28.57 
 
 		 630 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2548  heat shock protein 90  31.11 
 
 		 637 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00763476  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  30.56 
 
 		 637 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000082742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  31.9 
 
 		 640 aa  257  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  29.03 
 
 		 633 aa  257  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  30.08 
 
 		 634 aa  257  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2489  heat shock protein 90  26.18 
 
 		 628 aa  257  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.356578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  28.12 
 
 		 632 aa  257  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2443  heat shock protein 90  30.19 
 
 		 637 aa  257  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000425948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1728  heat shock protein 90  29.25 
 
 		 645 aa  256  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000167687  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004137  chaperone protein HtpG  32.22 
 
 		 634 aa  257  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>