292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0580 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  54.59 
 
 
634 aa  695    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  54.22 
 
 
624 aa  712    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  54.22 
 
 
624 aa  712    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  54.22 
 
 
624 aa  711    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  54.74 
 
 
634 aa  698    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  53.75 
 
 
624 aa  709    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  59.09 
 
 
632 aa  780    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  52 
 
 
634 aa  693    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  54.22 
 
 
624 aa  712    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0990  heat shock protein 90  58.27 
 
 
640 aa  779    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0890084  normal  0.343937 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3901  heat shock protein 90  52.89 
 
 
653 aa  700    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.795746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  59.25 
 
 
632 aa  779    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  53.19 
 
 
637 aa  704    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  53.34 
 
 
635 aa  693    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1947  heat shock protein 90  58.78 
 
 
632 aa  776    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.76829  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1323  heat shock protein 90  51.09 
 
 
623 aa  667    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  50.78 
 
 
623 aa  666    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  54.43 
 
 
634 aa  692    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  53.5 
 
 
637 aa  707    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000323275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  53.5 
 
 
637 aa  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1719  heat shock protein 90  82.67 
 
 
656 aa  1111    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  55.11 
 
 
636 aa  753    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3161  heat shock protein 90  61.1 
 
 
625 aa  805    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0144125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2370  heat shock protein 90  52.89 
 
 
642 aa  685    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0508031  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  59.78 
 
 
633 aa  780    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  52.02 
 
 
638 aa  691    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  56.31 
 
 
633 aa  759    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2849  heat shock protein 90  52.02 
 
 
638 aa  689    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000520054  decreased coverage  0.00000000518986 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  58.62 
 
 
632 aa  775    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  58.78 
 
 
632 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  53.44 
 
 
634 aa  716    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  54.59 
 
 
634 aa  700    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  52.25 
 
 
639 aa  693    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  58.62 
 
 
632 aa  774    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  52.19 
 
 
633 aa  672    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  54.22 
 
 
624 aa  712    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  54.46 
 
 
622 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0551  heat shock protein 90  60.81 
 
 
634 aa  792    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  54.12 
 
 
634 aa  694    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  54.46 
 
 
624 aa  706    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  51.01 
 
 
630 aa  668    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  51.39 
 
 
638 aa  686    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  58.78 
 
 
632 aa  777    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  53.65 
 
 
634 aa  691    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  56.11 
 
 
639 aa  728    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0266  heat shock protein 90  52.6 
 
 
636 aa  679    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.48191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0955  heat shock protein 90  58.15 
 
 
632 aa  772    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464007  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  54.22 
 
 
624 aa  712    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01327  heat shock protein 90  52.45 
 
 
634 aa  671    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  54.46 
 
 
624 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1175  heat shock protein 90  62.5 
 
 
650 aa  833    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3551  heat shock protein 90  60.97 
 
 
663 aa  803    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  53.91 
 
 
635 aa  713    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  51.92 
 
 
633 aa  674    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  59.72 
 
 
632 aa  782    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  57.28 
 
 
628 aa  757    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  57.28 
 
 
628 aa  757    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  65.51 
 
 
626 aa  863    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  58.78 
 
 
634 aa  773    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1428  heat shock protein 90  53.58 
 
 
637 aa  706    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000680402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  52.88 
 
 
637 aa  700    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000082742  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  50.39 
 
 
632 aa  674    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  54.22 
 
 
624 aa  712    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1998  heat shock protein 90  84.91 
 
 
666 aa  1124    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.154063  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2506  heat shock protein 90  58.22 
 
 
633 aa  766    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595688  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  59.09 
 
 
632 aa  779    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2894  heat shock protein 90  51.84 
 
 
640 aa  669    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.511153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  58.78 
 
 
632 aa  776    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  53.83 
 
 
635 aa  671    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  57.99 
 
 
632 aa  761    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  57.81 
 
 
643 aa  768    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  52.62 
 
 
626 aa  686    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  54.46 
 
 
623 aa  690    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2251  heat shock protein 90  53.34 
 
 
637 aa  705    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000711928  normal  0.266626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2323  heat shock protein 90  53.34 
 
 
637 aa  705    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000423215  hitchhiker  0.000689405 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  52.11 
 
 
652 aa  684    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1538  heat shock protein 90  52.72 
 
 
637 aa  679    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0309955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  58.93 
 
 
632 aa  766    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  53.03 
 
 
634 aa  691    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  58.78 
 
 
632 aa  776    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  59.09 
 
 
632 aa  779    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0580  heat shock protein 90  100 
 
 
653 aa  1340    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.360532 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1694  heat shock protein 90  51.63 
 
 
642 aa  656    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000812409  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2443  heat shock protein 90  53.34 
 
 
637 aa  705    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000425948  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0296  heat shock protein 90  52.6 
 
 
636 aa  679    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00313  heat shock protein 90  53.97 
 
 
634 aa  692    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  52.88 
 
 
637 aa  700    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  52.95 
 
 
637 aa  702    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2548  heat shock protein 90  52.88 
 
 
637 aa  699    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00763476  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0956  heat shock protein 90  52.69 
 
 
634 aa  687    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.538924  normal  0.713469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  58.31 
 
 
630 aa  773    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  54.37 
 
 
630 aa  695    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  53.03 
 
 
634 aa  683    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4289  heat shock protein 90  61.79 
 
 
668 aa  832    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  64.89 
 
 
629 aa  841    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0475  heat shock protein 90  62.9 
 
 
650 aa  828    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0953677 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  50.39 
 
 
633 aa  675    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  58.78 
 
 
632 aa  776    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0484  heat shock protein 90  60.55 
 
 
662 aa  817    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1548  heat shock protein 90  53.53 
 
 
630 aa  697    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00180815  normal  0.134338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>