More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1333 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 441 aa  898    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.89 
 
 		 444 aa  481  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0326  response regulator receiver domain-containing protein  28.41 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159286  normal  0.343021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4705  sensory box sensor histidine kinase  25.4 
 
 		 472 aa  160  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 446 aa  156  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0017  sensor histidine kinase  27.88 
 
 		 445 aa  150  5e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.428126 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0305  glycine cleavage system T protein  27.94 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2122  sensor histidine kinase  27.13 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5615  histidine kinase  31.47 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589471 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0098  histidine kinase  25.58 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 494 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4582  histidine kinase  28.98 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0779  sensor histidine kinase  36.44 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2860  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.32 
 
 		 437 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3256  ATPase domain-containing protein  28.92 
 
 		 551 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0867  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3155  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 555 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2846  ATP-binding region, ATPase-like protein  25.75 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4068  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3688  nitrogen regulation protein NtrY, putative  28.3 
 
 		 555 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 		 562 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  23.35 
 
 		 705 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1023  histidine kinase  26.18 
 
 		 562 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 		 454 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 562 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1035  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 562 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 		 456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.53289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 562 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 759 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 756 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2603  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3506  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996611 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.11 
 
 		 753 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 		 718 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  23.11 
 
 		 769 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.07 
 
 		 753 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0577  sensor histidine kinase  26.49 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122175  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 756 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  22.42 
 
 		 710 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 827 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 812 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  29.76 
 
 		 759 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6820  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  30.7 
 
 		 856 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.96 
 
 		 752 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.99 
 
 		 363 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 543 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 756 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 628 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  27.54 
 
 		 573 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 781 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 708 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 741 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 607 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  26.22 
 
 		 748 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 756 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 752 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000619377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00245745  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4001  histidine kinase  27.83 
 
 		 774 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000232996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4922  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.72 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5100  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.72 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  32.87 
 
 		 1258 aa  103  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 736 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  24.66 
 
 		 734 aa  103  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0353  nitrogen regulation protein NtrB  26.78 
 
 		 361 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 780 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4821  sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 756 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5047  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.45 
 
 		 361 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 744 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 581 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  26.87 
 
 		 581 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 756 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3020  histidine kinase  26.25 
 
 		 1282 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.06 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.035298  normal  0.857551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 746 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.39 
 
 		 679 aa  101  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  26.86 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  29.15 
 
 		 635 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  27.24 
 
 		 673 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 839 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  29.77 
 
 		 1092 aa  100  6e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 737 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 461 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 471 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 770 aa  99.8  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3892  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 762 aa  99.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 762 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 748 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 581 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 823 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 		 756 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0285475 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  28.26 
 
 		 369 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>