More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0017 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0017  sensor histidine kinase  100 
 
 		 445 aa  899    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.428126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 446 aa  189  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4582  histidine kinase  31.11 
 
 		 455 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0326  response regulator receiver domain-containing protein  29.3 
 
 		 450 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159286  normal  0.343021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 441 aa  156  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0305  glycine cleavage system T protein  29.81 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4705  sensory box sensor histidine kinase  24.21 
 
 		 472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 494 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589471 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2122  sensor histidine kinase  28.81 
 
 		 447 aa  139  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 426 aa  137  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0098  histidine kinase  31.26 
 
 		 439 aa  136  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0779  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 468 aa  133  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4419  sensor histidine kinase  24.94 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0577  sensor histidine kinase  25.96 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122175  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2846  ATP-binding region, ATPase-like protein  25.53 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3256  ATPase domain-containing protein  24.64 
 
 		 551 aa  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0867  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 555 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3688  nitrogen regulation protein NtrY, putative  29.13 
 
 		 555 aa  112  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3506  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996611 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2860  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.39 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3155  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 555 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 562 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  26.49 
 
 		 714 aa  109  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0746  sensor histidine kinase  25.71 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1023  histidine kinase  25.87 
 
 		 562 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 		 562 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4068  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 		 463 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1035  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 562 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  24.49 
 
 		 759 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 456 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.53289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 426 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.035298  normal  0.857551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 		 708 aa  98.6  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 581 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 851 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 		 729 aa  97.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 781 aa  97.4  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 		 756 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 447 aa  97.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 742 aa  96.7  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  29.82 
 
 		 581 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0704  sensor histidine kinase  25.32 
 
 		 713 aa  95.9  1e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.2301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.1 
 
 		 784 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  29.82 
 
 		 1710 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4526  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 772 aa  94.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 		 718 aa  94  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 752 aa  93.2  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2603  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 421 aa  93.2  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 779 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 753 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 733 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5615  histidine kinase  24.03 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  24.75 
 
 		 705 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.73 
 
 		 765 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.153032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 800 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 760 aa  91.3  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  26.04 
 
 		 734 aa  90.9  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1110  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 508 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230539  normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 803 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 		 745 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  28.45 
 
 		 484 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2577  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.4 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00911748  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.04 
 
 		 765 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 753 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3512  histidine kinase  29.55 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 581 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 		 753 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2430  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.67 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1838  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 764 aa  89  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 756 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.87 
 
 		 578 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3588  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.02 
 
 		 775 aa  87.8  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 534 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 543 aa  87.8  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1470  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 755 aa  87.8  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.797654  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 		 537 aa  87.4  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.32 
 
 		 770 aa  87  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.9 
 
 		 780 aa  87  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.11 
 
 		 759 aa  87  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 763 aa  87  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2197  two-component sensor histidine kinase (sensor protein AtoS)  28.33 
 
 		 1234 aa  87  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.993549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2579  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 		 761 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838184  normal  0.345494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 769 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.25 
 
 		 519 aa  86.7  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1446  nitrogen regulatory signal transduction histidine kinase NtrY  24.74 
 
 		 766 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 720 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.916012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  31.56 
 
 		 506 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.43 
 
 		 1306 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1444  nitrogen regulation protein ntrB  26.75 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  28.45 
 
 		 573 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 827 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.44 
 
 		 736 aa  84.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>