More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4419 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4419  sensor histidine kinase  100 
 
 		 431 aa  893    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 494 aa  156  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589471 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0098  histidine kinase  29.3 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0577  sensor histidine kinase  29.52 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122175  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2122  sensor histidine kinase  30 
 
 		 447 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 426 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0779  sensor histidine kinase  37.29 
 
 		 468 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 457 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2860  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.94 
 
 		 437 aa  126  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0326  response regulator receiver domain-containing protein  25.22 
 
 		 450 aa  126  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159286  normal  0.343021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3155  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 555 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0305  glycine cleavage system T protein  27.13 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3688  nitrogen regulation protein NtrY, putative  29.32 
 
 		 555 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.53289 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 562 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3256  ATPase domain-containing protein  27.91 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0867  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 555 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 562 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0017  sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 445 aa  117  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.428126 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1023  histidine kinase  27.17 
 
 		 562 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2846  ATP-binding region, ATPase-like protein  24.55 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4068  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1035  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 445 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3506  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 		 426 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.035298  normal  0.857551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4705  sensory box sensor histidine kinase  23.16 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3118  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.68 
 
 		 817 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4410  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  22.72 
 
 		 800 aa  99.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2799  putative nitrogen regulation protein NtrY  23.52 
 
 		 802 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2281  putative nitrogen regulation protein NtrY  23.52 
 
 		 802 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0640916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2359  putative nitrogen regulation protein NtrY  23.52 
 
 		 802 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252159  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0148  nitrogen regulation protein NtrY, putative  23.52 
 
 		 806 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155051  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0352  sensor kinase protein  23.52 
 
 		 787 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.452742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0167  sensor histidine kinase  23.52 
 
 		 802 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0157  sensor histidine kinase  23.52 
 
 		 802 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  31.38 
 
 		 705 aa  97.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0134  nitrogen regulation protein NtrY, putative  22.93 
 
 		 787 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.822432  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 441 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6472  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.58 
 
 		 804 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 736 aa  93.6  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4196  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 680 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0175164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.16 
 
 		 803 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.27 
 
 		 800 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1116  nitrogen regulation protein NtrY  26.18 
 
 		 774 aa  92  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.79 
 
 		 804 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1074  nitrogen regulation protein NtrY  26.18 
 
 		 774 aa  92  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000929955  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.57 
 
 		 800 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.510583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.79 
 
 		 804 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.537383  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.79 
 
 		 804 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655307  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0746  sensor histidine kinase  23.08 
 
 		 455 aa  90.1  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 771 aa  90.1  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.542091  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0542  nitrogen regulation protein NtrY  28.85 
 
 		 742 aa  89.7  8e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0128365  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3176  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.57 
 
 		 804 aa  90.1  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2837  nitrogen regulation protein, NtrB signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 368 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.62 
 
 		 770 aa  88.2  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 742 aa  88.2  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1457  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.07 
 
 		 368 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.291348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  27.6 
 
 		 484 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 543 aa  87.4  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 812 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2490  sensor histidine kinase  27.14 
 
 		 600 aa  86.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4582  histidine kinase  26.69 
 
 		 455 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 756 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 708 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.63 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.785514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5615  histidine kinase  23.99 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 729 aa  85.9  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  30.29 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0078  histidine kinase  27.51 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1575  nitrogen regulation protein  29.18 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0711174  normal  0.0291432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 		 755 aa  85.5  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 734 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.54 
 
 		 753 aa  85.5  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.8 
 
 		 744 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  25.89 
 
 		 573 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 526 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  26.94 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4001  histidine kinase  26.64 
 
 		 774 aa  83.2  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000232996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.05 
 
 		 763 aa  83.2  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 598 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 677 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 718 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.7 
 
 		 768 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3050  PAS sensor protein  30.09 
 
 		 653 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.88 
 
 		 827 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2071  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.73 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0183678  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 680 aa  81.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  22.94 
 
 		 734 aa  80.9  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 525 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.35 
 
 		 1255 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>