More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1023 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3256  ATPase domain-containing protein  73.53 
 
 		 551 aa  816    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3688  nitrogen regulation protein NtrY, putative  74.78 
 
 		 555 aa  814    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1023  histidine kinase  100 
 
 		 562 aa  1152    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1035  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  94.66 
 
 		 562 aa  1052    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  96.62 
 
 		 562 aa  1112    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  98.4 
 
 		 562 aa  1132    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.9 
 
 		 562 aa  998    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0867  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  74.82 
 
 		 555 aa  847    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3155  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  74.82 
 
 		 555 aa  849    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.4 
 
 		 457 aa  551  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.03 
 
 		 456 aa  548  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.53289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  69.01 
 
 		 454 aa  533  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4068  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.08 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  62.12 
 
 		 451 aa  519  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2846  ATP-binding region, ATPase-like protein  64.27 
 
 		 452 aa  511  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2860  ATP-binding region, ATPase-like protein  56.03 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3506  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.47 
 
 		 450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996611 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0577  sensor histidine kinase  39.06 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122175  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2122  sensor histidine kinase  30.25 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5615  histidine kinase  27.27 
 
 		 429 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0098  histidine kinase  29.18 
 
 		 439 aa  147  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589471 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 494 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0779  sensor histidine kinase  28.54 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0305  glycine cleavage system T protein  28.08 
 
 		 448 aa  131  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.035298  normal  0.857551 
 
 
-
 
NC_002950  PG0746  sensor histidine kinase  26.18 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4705  sensory box sensor histidine kinase  23.38 
 
 		 472 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0326  response regulator receiver domain-containing protein  24.49 
 
 		 450 aa  120  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159286  normal  0.343021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4419  sensor histidine kinase  27.17 
 
 		 431 aa  116  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 759 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 		 729 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 710 aa  111  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 736 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 755 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 445 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 708 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  25.3 
 
 		 767 aa  107  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4582  histidine kinase  29.83 
 
 		 455 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0017  sensor histidine kinase  26.53 
 
 		 445 aa  107  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.428126 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 752 aa  107  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  30.13 
 
 		 581 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 753 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 733 aa  105  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 444 aa  104  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  24.87 
 
 		 714 aa  104  5e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 		 753 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 581 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2591  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 762 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.682378  normal  0.0198144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 737 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 		 769 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 		 744 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  29.24 
 
 		 705 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 		 756 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0704  sensor histidine kinase  26.06 
 
 		 713 aa  102  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.2301  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  25.45 
 
 		 759 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 		 733 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 718 aa  100  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.76 
 
 		 749 aa  100  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 757 aa  100  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.203555  normal  0.0623449 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.02 
 
 		 530 aa  99.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  27.02 
 
 		 530 aa  99.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  29.65 
 
 		 573 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 784 aa  97.4  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 		 770 aa  97.4  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  24.87 
 
 		 734 aa  97.1  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 764 aa  96.3  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.866376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.68 
 
 		 812 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 		 779 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2579  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 761 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838184  normal  0.345494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1838  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 764 aa  96.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.45 
 
 		 764 aa  95.9  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.88 
 
 		 763 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 725 aa  93.6  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 745 aa  93.2  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 799 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.17 
 
 		 768 aa  93.2  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1446  nitrogen regulatory signal transduction histidine kinase NtrY  24.39 
 
 		 766 aa  92.8  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 757 aa  92.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2603  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 		 421 aa  92.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  27.69 
 
 		 611 aa  92.8  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 742 aa  92  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3588  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 775 aa  92.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 780 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 581 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 		 731 aa  91.7  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 762 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 		 756 aa  91.3  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  22.76 
 
 		 712 aa  90.5  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.5 
 
 		 827 aa  90.5  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0249  histidine kinase  27.01 
 
 		 459 aa  90.5  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  22.83 
 
 		 614 aa  90.1  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 		 800 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.510583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 		 756 aa  89.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  26.18 
 
 		 621 aa  89.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.2 
 
 		 756 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 736 aa  89.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>