More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1902 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 448 aa  894    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.43 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2122  sensor histidine kinase  39.43 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0098  histidine kinase  38.5 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0305  glycine cleavage system T protein  36.97 
 
 		 448 aa  285  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724107 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0779  sensor histidine kinase  32.49 
 
 		 468 aa  219  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 445 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3506  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 450 aa  166  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996611 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4582  histidine kinase  31.12 
 
 		 455 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0577  sensor histidine kinase  29.32 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122175  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.53289 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4419  sensor histidine kinase  29.01 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 457 aa  152  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 446 aa  152  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0326  response regulator receiver domain-containing protein  29.27 
 
 		 450 aa  151  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159286  normal  0.343021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 451 aa  150  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4068  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 463 aa  150  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 562 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 562 aa  147  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3155  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 555 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0867  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 555 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 562 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1023  histidine kinase  28.5 
 
 		 562 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.035298  normal  0.857551 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2860  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.7 
 
 		 437 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3256  ATPase domain-containing protein  29.15 
 
 		 551 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5615  histidine kinase  28.03 
 
 		 429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2846  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.23 
 
 		 452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3688  nitrogen regulation protein NtrY, putative  32.11 
 
 		 555 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.27 
 
 		 444 aa  139  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0746  sensor histidine kinase  27.44 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4705  sensory box sensor histidine kinase  28.29 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0017  sensor histidine kinase  28.67 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.428126 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  31.25 
 
 		 705 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1035  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 562 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 744 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  28.14 
 
 		 734 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 736 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 752 aa  130  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 753 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 769 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3118  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 817 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 		 756 aa  126  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 759 aa  126  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 729 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  25.74 
 
 		 767 aa  124  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 733 aa  124  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 804 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 804 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.537383  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 804 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 764 aa  123  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 749 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 718 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 753 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3588  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.08 
 
 		 775 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 731 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3176  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 		 804 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 800 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.510583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 812 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 		 757 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 827 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6472  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 804 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 742 aa  117  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 753 aa  116  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  22.86 
 
 		 759 aa  116  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0134  nitrogen regulation protein NtrY, putative  24.78 
 
 		 787 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.822432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4410  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 800 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0352  sensor kinase protein  24.84 
 
 		 787 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.452742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0167  sensor histidine kinase  24.84 
 
 		 802 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0157  sensor histidine kinase  24.84 
 
 		 802 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278492  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 733 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0148  nitrogen regulation protein NtrY, putative  25.05 
 
 		 806 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155051  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 710 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2281  putative nitrogen regulation protein NtrY  25.05 
 
 		 802 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0640916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 768 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2359  putative nitrogen regulation protein NtrY  25.05 
 
 		 802 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252159  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2799  putative nitrogen regulation protein NtrY  25.05 
 
 		 802 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.48 
 
 		 763 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 781 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2081  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 816 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  35.84 
 
 		 573 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 737 aa  112  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1074  nitrogen regulation protein NtrY  22.83 
 
 		 774 aa  112  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000929955  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1116  nitrogen regulation protein NtrY  22.61 
 
 		 774 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4526  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 772 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 740 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 738 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 780 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 803 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 734 aa  109  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 		 800 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3892  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 762 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 762 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235789  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 754 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187529  normal  0.0210363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 746 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 689 aa  107  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 		 765 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>