More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0577 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0577  sensor histidine kinase  100 
 
 		 433 aa  887    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122175  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4068  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 463 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2860  ATP-binding region, ATPase-like protein  41.39 
 
 		 437 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3155  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 555 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3256  ATPase domain-containing protein  39.47 
 
 		 551 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 		 457 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0867  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 555 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.53289 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2846  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.79 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 454 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 562 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 562 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1023  histidine kinase  39.06 
 
 		 562 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 562 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3688  nitrogen regulation protein NtrY, putative  37.59 
 
 		 555 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1035  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 562 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3506  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 450 aa  206  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996611 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2122  sensor histidine kinase  28.27 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0779  sensor histidine kinase  29.03 
 
 		 468 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589471 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4419  sensor histidine kinase  29.52 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0305  glycine cleavage system T protein  26.98 
 
 		 448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.035298  normal  0.857551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 494 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0098  histidine kinase  28.45 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5615  histidine kinase  26.02 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 446 aa  126  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0704  sensor histidine kinase  24.56 
 
 		 713 aa  122  9.999999999999999e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.2301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0326  response regulator receiver domain-containing protein  28.46 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159286  normal  0.343021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  31.17 
 
 		 705 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18234  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  24.75 
 
 		 714 aa  114  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 742 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 		 445 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0017  sensor histidine kinase  25.64 
 
 		 445 aa  113  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.428126 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 756 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 444 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 		 768 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 718 aa  110  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 814 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  28.84 
 
 		 530 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.84 
 
 		 530 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2898  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230241  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 680 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4582  histidine kinase  27.41 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 753 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 		 755 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4705  sensory box sensor histidine kinase  25.65 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 799 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 		 749 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4526  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 772 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 765 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 		 779 aa  104  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 773 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  25.74 
 
 		 767 aa  103  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  26.02 
 
 		 712 aa  103  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 710 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 733 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 752 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4467  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 589 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0773722  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 708 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  23.5 
 
 		 748 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 769 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 759 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4448  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 589 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 764 aa  100  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0746  sensor histidine kinase  24.04 
 
 		 455 aa  100  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 753 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 737 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 745 aa  99.8  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 655 aa  100  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.72 
 
 		 746 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 756 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.62 
 
 		 733 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.94 
 
 		 731 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.49 
 
 		 784 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3349  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 823 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 799 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.70723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 543 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2822  PAS sensor protein  25.77 
 
 		 799 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.354635 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.69 
 
 		 753 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2607  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 		 747 aa  98.2  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.515354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.52 
 
 		 770 aa  98.2  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0077  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  24.21 
 
 		 811 aa  97.8  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000219775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 756 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1838  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.2 
 
 		 764 aa  97.8  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2603  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 421 aa  97.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4312  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 591 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.55 
 
 		 740 aa  97.4  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 		 576 aa  96.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.16 
 
 		 823 aa  96.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0542  nitrogen regulation protein NtrY  24.44 
 
 		 742 aa  96.7  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0128365  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 744 aa  96.3  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.83 
 
 		 857 aa  95.9  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 760 aa  95.9  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.83 
 
 		 729 aa  96.3  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 470 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.43 
 
 		 763 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>