More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2122 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2122  sensor histidine kinase  100 
 
 
447 aa  900    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0305  glycine cleavage system T protein  50.33 
 
 
448 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0098  histidine kinase  38.8 
 
 
439 aa  293  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
448 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.589471 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
426 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
494 aa  272  9e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0779  sensor histidine kinase  37.79 
 
 
468 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
446 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3688  nitrogen regulation protein NtrY, putative  31.42 
 
 
555 aa  163  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0577  sensor histidine kinase  28.27 
 
 
433 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122175  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3506  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
450 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.996611 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0867  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
555 aa  159  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
562 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1023  histidine kinase  30.25 
 
 
562 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3155  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
555 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3256  ATPase domain-containing protein  30.67 
 
 
551 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0326  response regulator receiver domain-containing protein  27.76 
 
 
450 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159286  normal  0.343021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
562 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
456 aa  156  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.53289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4068  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
463 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
445 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
562 aa  153  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1035  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
562 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
457 aa  151  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4582  histidine kinase  27.46 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2846  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.57 
 
 
452 aa  143  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4705  sensory box sensor histidine kinase  26.07 
 
 
472 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2860  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.74 
 
 
437 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0017  sensor histidine kinase  28.81 
 
 
445 aa  137  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.428126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4419  sensor histidine kinase  30 
 
 
431 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
756 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  26 
 
 
769 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 
753 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
718 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.035298  normal  0.857551 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
759 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 
729 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  26.33 
 
 
734 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 
752 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 
753 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  22.71 
 
 
759 aa  127  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
708 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
740 aa  123  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
581 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  31.47 
 
 
581 aa  123  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3588  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 
775 aa  122  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 
756 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
749 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  25.59 
 
 
705 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5615  histidine kinase  25.4 
 
 
429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 
763 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
741 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  33.63 
 
 
573 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 
754 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187529  normal  0.0210363 
 
 
-
 
NC_002950  PG0746  sensor histidine kinase  24.15 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 
764 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.866376 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 
731 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.42 
 
 
799 aa  118  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 
742 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 
760 aa  117  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2822  PAS sensor protein  22.42 
 
 
799 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.354635 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
710 aa  116  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2603  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.63 
 
 
421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.2 
 
 
799 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.70723  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 
756 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0285475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 
756 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.7 
 
 
768 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 
744 aa  114  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 
756 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 
770 aa  113  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 
734 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
780 aa  113  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 
736 aa  113  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2138  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
838 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2156  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
838 aa  113  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494862  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
736 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  26.67 
 
 
710 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
838 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372664  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 
827 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5939  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
838 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 
733 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2175  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
838 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 
737 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  25.71 
 
 
767 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  24.89 
 
 
748 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  24.41 
 
 
712 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
838 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 
781 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0542  nitrogen regulation protein NtrY  23.54 
 
 
742 aa  110  6e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0128365  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
838 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  26.82 
 
 
835 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1722  sensory box histidine kinase  26.82 
 
 
879 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  26.82 
 
 
835 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.11 
 
 
812 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  26.82 
 
 
879 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  26.82 
 
 
835 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>