More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2940 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 
757 aa  644    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.203555  normal  0.0623449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2822  PAS sensor protein  95.24 
 
 
799 aa  1485    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.354635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  95.62 
 
 
799 aa  1491    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.70723  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.42 
 
 
755 aa  658    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
799 aa  1600    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  72.74 
 
 
779 aa  1040    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  71.63 
 
 
753 aa  1026    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  72.8 
 
 
814 aa  1153    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.59 
 
 
745 aa  624  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1838  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.56 
 
 
764 aa  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2591  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.33 
 
 
762 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.682378  normal  0.0198144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.02 
 
 
763 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2579  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.1 
 
 
761 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838184  normal  0.345494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1446  nitrogen regulatory signal transduction histidine kinase NtrY  47.59 
 
 
766 aa  595  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263583  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.4 
 
 
762 aa  598  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 
784 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 
771 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.542091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1116  nitrogen regulation protein NtrY  43.67 
 
 
774 aa  572  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1074  nitrogen regulation protein NtrY  43.67 
 
 
774 aa  571  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000929955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 
763 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  45.32 
 
 
759 aa  551  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 
756 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.52 
 
 
757 aa  522  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
779 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865325  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
756 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0542  nitrogen regulation protein NtrY  38.64 
 
 
742 aa  484  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0128365  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
754 aa  427  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187529  normal  0.0210363 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
760 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
740 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2607  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
747 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.515354  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 
752 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
753 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
769 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
753 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
759 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 
768 aa  395  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
742 aa  379  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
756 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
753 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  35.56 
 
 
767 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
773 aa  364  4e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  30.66 
 
 
714 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0704  sensor histidine kinase  30.45 
 
 
713 aa  314  4.999999999999999e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.2301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
756 aa  308  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
752 aa  295  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000619377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  32.27 
 
 
748 aa  290  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
737 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
748 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
731 aa  283  9e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
746 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
756 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
756 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
738 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
741 aa  257  7e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
733 aa  250  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
733 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
736 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
749 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
729 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  35.02 
 
 
734 aa  237  6e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
736 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
734 aa  235  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
718 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2081  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
816 aa  230  7e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
708 aa  229  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.99 
 
 
736 aa  226  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  29.99 
 
 
710 aa  226  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
845 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468501 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
725 aa  224  7e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  35.21 
 
 
712 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  30.11 
 
 
705 aa  220  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
710 aa  219  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3349  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
823 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
823 aa  214  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
744 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
827 aa  211  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
765 aa  208  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.153032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0077  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.02 
 
 
811 aa  208  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000219775  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3892  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
762 aa  207  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
762 aa  207  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235789  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0148  nitrogen regulation protein NtrY, putative  27.48 
 
 
806 aa  207  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155051  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0352  sensor kinase protein  27.65 
 
 
787 aa  207  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.452742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0167  sensor histidine kinase  27.65 
 
 
802 aa  207  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0157  sensor histidine kinase  27.65 
 
 
802 aa  207  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2359  putative nitrogen regulation protein NtrY  27.48 
 
 
802 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252159  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0134  nitrogen regulation protein NtrY, putative  32.28 
 
 
787 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.822432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2281  putative nitrogen regulation protein NtrY  27.48 
 
 
802 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0640916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2799  putative nitrogen regulation protein NtrY  27.48 
 
 
802 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
812 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3176  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
804 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
803 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
800 aa  204  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.510583  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 
764 aa  202  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
804 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
804 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.537383  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 
804 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655307  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
770 aa  200  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6472  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
804 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4526  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
772 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
655 aa  197  6e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>