More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1491 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  73 
 
 		 753 aa  1015    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  72.68 
 
 		 799 aa  1135    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2822  PAS sensor protein  74.78 
 
 		 799 aa  1129    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.354635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  74.32 
 
 		 779 aa  1038    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  74.62 
 
 		 799 aa  1128    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.70723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.45 
 
 		 755 aa  653    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 814 aa  1628    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 		 757 aa  630  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.203555  normal  0.0623449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 		 763 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2591  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.7 
 
 		 762 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.682378  normal  0.0198144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1838  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.96 
 
 		 764 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 		 762 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2579  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.69 
 
 		 761 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838184  normal  0.345494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.16 
 
 		 745 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1446  nitrogen regulatory signal transduction histidine kinase NtrY  45.28 
 
 		 766 aa  585  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 784 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1074  nitrogen regulation protein NtrY  44.29 
 
 		 774 aa  552  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000929955  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1116  nitrogen regulation protein NtrY  44.35 
 
 		 774 aa  555  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 		 763 aa  552  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 771 aa  548  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.542091  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  43.43 
 
 		 759 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 779 aa  524  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865325  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 756 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 756 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 		 757 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0542  nitrogen regulation protein NtrY  38.92 
 
 		 742 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0128365  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 760 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2607  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 747 aa  422  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.515354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 740 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.52 
 
 		 754 aa  412  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187529  normal  0.0210363 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 752 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 753 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 759 aa  402  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.52 
 
 		 753 aa  402  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 769 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 753 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 768 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 742 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  34.28 
 
 		 767 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 756 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 773 aa  348  3e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  32.23 
 
 		 714 aa  323  9.999999999999999e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0704  sensor histidine kinase  31.31 
 
 		 713 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.2301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  31.32 
 
 		 748 aa  298  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 752 aa  298  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000619377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 756 aa  298  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 756 aa  295  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 748 aa  292  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 756 aa  289  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 746 aa  280  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 738 aa  278  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 737 aa  270  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 731 aa  261  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 736 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 741 aa  254  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  31.91 
 
 		 710 aa  253  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 736 aa  253  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 733 aa  246  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 733 aa  244  5e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 718 aa  239  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 736 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 749 aa  237  6e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 729 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  29.85 
 
 		 705 aa  235  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2081  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 816 aa  234  6e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 708 aa  231  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 845 aa  228  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468501 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 734 aa  228  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  34.24 
 
 		 712 aa  227  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  35.01 
 
 		 734 aa  226  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 710 aa  224  7e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 803 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 725 aa  213  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 744 aa  213  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 823 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 762 aa  211  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235789  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3892  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 762 aa  211  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3349  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 823 aa  211  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0077  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.33 
 
 		 811 aa  211  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000219775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0593  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 776 aa  207  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3176  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 804 aa  207  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 800 aa  207  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.510583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 827 aa  206  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4526  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 772 aa  205  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 804 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 804 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.537383  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 804 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6472  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 804 aa  204  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 780 aa  204  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 812 aa  204  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 764 aa  204  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 765 aa  203  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.153032 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0352  sensor kinase protein  27.61 
 
 		 787 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.452742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2359  putative nitrogen regulation protein NtrY  27.69 
 
 		 802 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252159  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0148  nitrogen regulation protein NtrY, putative  27.69 
 
 		 806 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0157  sensor histidine kinase  27.69 
 
 		 802 aa  202  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278492  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2799  putative nitrogen regulation protein NtrY  27.69 
 
 		 802 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0167  sensor histidine kinase  27.69 
 
 		 802 aa  202  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2281  putative nitrogen regulation protein NtrY  27.69 
 
 		 802 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0640916  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0134  nitrogen regulation protein NtrY, putative  33.06 
 
 		 787 aa  201  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.822432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>