More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1929 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
742 aa  1493    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.86 
 
 
773 aa  615  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 
768 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
779 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865325  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
760 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  36.53 
 
 
759 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
753 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
779 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
756 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1838  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
764 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
756 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
757 aa  385  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
763 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
745 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
753 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
753 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_004310  BR1116  nitrogen regulation protein NtrY  36.45 
 
 
774 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.09 
 
 
799 aa  376  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
769 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1074  nitrogen regulation protein NtrY  36.29 
 
 
774 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000929955  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2822  PAS sensor protein  37.65 
 
 
799 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.354635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2591  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
762 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.682378  normal  0.0198144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2607  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
747 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.515354  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
799 aa  372  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.70723  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
771 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.542091  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2579  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
761 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838184  normal  0.345494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
814 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
754 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187529  normal  0.0210363 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
759 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
784 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
740 aa  364  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
762 aa  362  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1446  nitrogen regulatory signal transduction histidine kinase NtrY  36.36 
 
 
766 aa  360  4e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263583  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  34.97 
 
 
767 aa  358  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
755 aa  357  5e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
757 aa  357  5.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.203555  normal  0.0623449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
756 aa  354  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
753 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
763 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0542  nitrogen regulation protein NtrY  33.2 
 
 
742 aa  339  9.999999999999999e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0128365  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  32.26 
 
 
714 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
752 aa  337  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0704  sensor histidine kinase  31.13 
 
 
713 aa  316  9e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.2301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
756 aa  296  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
756 aa  282  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
756 aa  280  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
738 aa  276  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
733 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
746 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  28.97 
 
 
748 aa  271  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
748 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
731 aa  257  6e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
737 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
733 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
752 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000619377  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
718 aa  246  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
736 aa  238  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  31.1 
 
 
712 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
736 aa  234  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  31.02 
 
 
705 aa  234  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
736 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.01 
 
 
845 aa  231  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468501 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  29.82 
 
 
710 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
708 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
734 aa  226  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
749 aa  226  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
725 aa  223  8e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2081  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
816 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 
710 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
729 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  29.79 
 
 
734 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
744 aa  212  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
765 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.153032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
781 aa  211  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
764 aa  210  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3588  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
775 aa  207  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
741 aa  207  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
765 aa  203  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
803 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4526  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.42 
 
 
772 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
756 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0285475 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
827 aa  197  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3892  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
762 aa  197  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3349  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
823 aa  196  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 
762 aa  195  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235789  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
823 aa  194  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
800 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
770 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0077  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  26.88 
 
 
811 aa  191  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000219775  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0593  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
776 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
812 aa  188  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3176  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
804 aa  188  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
800 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.510583  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
780 aa  187  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4410  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
800 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0134  nitrogen regulation protein NtrY, putative  32.08 
 
 
787 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.822432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3118  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
817 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728829  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0148  nitrogen regulation protein NtrY, putative  31.57 
 
 
806 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155051  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2799  putative nitrogen regulation protein NtrY  31.57 
 
 
802 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2359  putative nitrogen regulation protein NtrY  31.57 
 
 
802 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>