More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1038 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
655 aa  1292    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
749 aa  251  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
731 aa  242  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  27.61 
 
 
748 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
733 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
598 aa  233  1e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 
741 aa  231  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
733 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 
845 aa  227  6e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
748 aa  226  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
708 aa  225  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
736 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
725 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 
738 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 
737 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
746 aa  217  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
729 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
756 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
756 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  25.95 
 
 
734 aa  211  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  27.44 
 
 
712 aa  211  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  25.57 
 
 
705 aa  211  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 
734 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
752 aa  208  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000619377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
740 aa  208  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
736 aa  206  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 
718 aa  206  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  30.43 
 
 
767 aa  204  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
779 aa  203  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865325  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
710 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 
756 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  24.4 
 
 
710 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1116  nitrogen regulation protein NtrY  29.37 
 
 
774 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 
736 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1074  nitrogen regulation protein NtrY  29.37 
 
 
774 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000929955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3588  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 
775 aa  199  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 
752 aa  199  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3892  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 
762 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
799 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 
762 aa  197  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235789  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2607  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
747 aa  197  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.515354  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 
764 aa  196  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
756 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
763 aa  196  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
771 aa  196  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.542091  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
753 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
769 aa  195  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
754 aa  194  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187529  normal  0.0210363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4526  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 
772 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
753 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
757 aa  192  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.203555  normal  0.0623449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
784 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 
779 aa  191  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 
799 aa  191  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.70723  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2822  PAS sensor protein  27.57 
 
 
799 aa  191  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.354635 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
744 aa  191  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 
753 aa  191  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
765 aa  190  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.153032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
760 aa  190  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
753 aa  187  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  27.31 
 
 
759 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 
759 aa  184  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 
768 aa  183  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
812 aa  183  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
765 aa  183  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
757 aa  183  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2081  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
816 aa  182  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 
742 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
756 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0285475 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3349  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
823 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
814 aa  181  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
755 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
827 aa  181  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
745 aa  180  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0542  nitrogen regulation protein NtrY  26.84 
 
 
742 aa  180  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0128365  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.89 
 
 
764 aa  180  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.866376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
803 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
800 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2591  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 
762 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.682378  normal  0.0198144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0593  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
776 aa  179  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 
780 aa  179  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0077  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  26.13 
 
 
811 aa  178  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000219775  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4001  histidine kinase  23.42 
 
 
774 aa  178  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000232996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
823 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
756 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
756 aa  177  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4410  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
800 aa  177  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 
770 aa  176  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1838  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
764 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2579  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
761 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838184  normal  0.345494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 
762 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
763 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1446  nitrogen regulatory signal transduction histidine kinase NtrY  28.97 
 
 
766 aa  171  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263583  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2359  putative nitrogen regulation protein NtrY  27.56 
 
 
802 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252159  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0167  sensor histidine kinase  27.56 
 
 
802 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0157  sensor histidine kinase  27.56 
 
 
802 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278492  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2281  putative nitrogen regulation protein NtrY  27.56 
 
 
802 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0640916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0352  sensor kinase protein  27.56 
 
 
787 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.452742  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3118  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
817 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728829  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3176  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
804 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>