More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0746 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0746  sensor histidine kinase  100 
 
 		 455 aa  924    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 426 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.035298  normal  0.857551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5615  histidine kinase  33.25 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 451 aa  163  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 456 aa  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.53289 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589471 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2846  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.09 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 		 446 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2860  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.85 
 
 		 437 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 		 562 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4068  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 562 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1023  histidine kinase  26.18 
 
 		 562 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3155  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 555 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 562 aa  124  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0867  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 555 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3256  ATPase domain-containing protein  24.62 
 
 		 551 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.74 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3688  nitrogen regulation protein NtrY, putative  24.76 
 
 		 555 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3506  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996611 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2122  sensor histidine kinase  24.15 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 457 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 454 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1035  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 562 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0305  glycine cleavage system T protein  26.77 
 
 		 448 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0098  histidine kinase  24.94 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0017  sensor histidine kinase  25.71 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.428126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.42 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.49 
 
 		 814 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0779  sensor histidine kinase  23.28 
 
 		 468 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0326  response regulator receiver domain-containing protein  22.91 
 
 		 450 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159286  normal  0.343021 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.78 
 
 		 733 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0577  sensor histidine kinase  24.42 
 
 		 433 aa  100  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.8 
 
 		 779 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.27 
 
 		 731 aa  97.4  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 441 aa  97.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18234  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.23 
 
 		 742 aa  96.3  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4582  histidine kinase  24.26 
 
 		 455 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4419  sensor histidine kinase  22.99 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.32 
 
 		 737 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 		 753 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 527 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  25.72 
 
 		 465 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 390 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 		 768 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 793 aa  90.5  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 630 aa  90.5  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.65 
 
 		 753 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 516 aa  90.1  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.3 
 
 		 733 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  25.36 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 513 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.01 
 
 		 708 aa  89.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.32 
 
 		 765 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  25.36 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  25.36 
 
 		 465 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.54 
 
 		 757 aa  89.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.203555  normal  0.0623449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0208  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 708 aa  89.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.832424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.18 
 
 		 512 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 		 736 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 781 aa  88.6  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  25 
 
 		 465 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2081  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 		 816 aa  88.2  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 510 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2607  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.98 
 
 		 747 aa  87.4  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.515354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.88 
 
 		 736 aa  87.4  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  27.63 
 
 		 484 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 508 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  19.86 
 
 		 725 aa  87  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  22.33 
 
 		 734 aa  86.7  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.43 
 
 		 363 aa  86.7  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.01 
 
 		 749 aa  86.7  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4705  sensory box sensor histidine kinase  21.4 
 
 		 472 aa  86.7  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 662 aa  86.7  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 632 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 632 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 632 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  24.7 
 
 		 465 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2591  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.53 
 
 		 762 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.682378  normal  0.0198144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 503 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.99 
 
 		 734 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4190  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 		 842 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6472  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.09 
 
 		 804 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 804 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  25 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  24.76 
 
 		 621 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 804 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.537383  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 804 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 534 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  24.59 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3588  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 775 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  25.41 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>