More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4190 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4190  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
842 aa  1708    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2805  sensor histidine kinase/response regulator fused protein, ATPase domain  33.53 
 
 
836 aa  442  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130199  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0124  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
851 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4031  sensory box histidine kinase/response regulator  34.95 
 
 
851 aa  304  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4095  sensory box histidine kinase/response regulator  34.95 
 
 
851 aa  303  9e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1028  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
870 aa  284  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.636365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 
740 aa  280  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  35.09 
 
 
726 aa  277  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
741 aa  272  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2378  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 
551 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.81922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
632 aa  259  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
926 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
1095 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
1089 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
1022 aa  254  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 
999 aa  254  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 
772 aa  253  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 
695 aa  253  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 
810 aa  251  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  36.76 
 
 
691 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 
553 aa  250  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.638317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
1092 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  33.09 
 
 
1086 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 
622 aa  248  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  32.51 
 
 
622 aa  248  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1968  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.06 
 
 
933 aa  248  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  37.02 
 
 
847 aa  248  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3231  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
824 aa  248  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.399337  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
655 aa  248  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  36.45 
 
 
646 aa  247  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3545  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
553 aa  247  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.70141  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
1050 aa  247  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  37.5 
 
 
691 aa  246  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
1165 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.68 
 
 
834 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 
926 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  34.51 
 
 
812 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.38 
 
 
732 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 
686 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
1076 aa  245  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  37.5 
 
 
701 aa  245  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 
1381 aa  245  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  30.41 
 
 
936 aa  244  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
743 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0036  histidine kinase  38.69 
 
 
556 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.526737  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 
889 aa  242  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
916 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
858 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  33.16 
 
 
1092 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
1103 aa  241  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
1631 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  37.79 
 
 
695 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  36.21 
 
 
646 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0225  PAS  39.21 
 
 
673 aa  239  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
789 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 
977 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 
673 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  38.19 
 
 
490 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  32.57 
 
 
692 aa  239  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
618 aa  239  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
1086 aa  239  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 
789 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 
789 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 
573 aa  239  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  37.19 
 
 
1036 aa  238  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  36.87 
 
 
529 aa  238  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
957 aa  238  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 
807 aa  238  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
1651 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 
701 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0290  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
758 aa  237  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.312795 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 
905 aa  237  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 
660 aa  237  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 
492 aa  237  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3375  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
714 aa  237  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0764  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 
568 aa  237  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
1215 aa  237  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
1053 aa  236  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
864 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 
1067 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
864 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
622 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
966 aa  236  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
979 aa  236  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 
1036 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3546  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 
688 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  37.72 
 
 
827 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
998 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 
688 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2228  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 
688 aa  235  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  34.09 
 
 
695 aa  235  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
845 aa  235  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
827 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
1050 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
812 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 
936 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  37.47 
 
 
956 aa  234  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  37.37 
 
 
537 aa  234  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
689 aa  234  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
890 aa  234  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.622794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>