More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3279 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 834 aa  1665    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3231  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 824 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.399337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4190  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 		 842 aa  251  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0124  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 851 aa  239  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4031  sensory box histidine kinase/response regulator  31.98 
 
 		 851 aa  240  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2805  sensor histidine kinase/response regulator fused protein, ATPase domain  27.66 
 
 		 836 aa  239  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4095  sensory box histidine kinase/response regulator  31.79 
 
 		 851 aa  238  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1028  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 870 aa  230  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.636365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 		 740 aa  204  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 741 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 		 1651 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1968  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.41 
 
 		 933 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 905 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 		 655 aa  197  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  35.03 
 
 		 544 aa  197  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  35.14 
 
 		 541 aa  197  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  34.88 
 
 		 541 aa  197  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 		 1631 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  34.88 
 
 		 541 aa  197  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  30.06 
 
 		 726 aa  196  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 		 810 aa  195  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  30.99 
 
 		 1036 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 807 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  33.33 
 
 		 534 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 1646 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6058  histidine kinase  26.79 
 
 		 697 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 720 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 966 aa  190  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  30.35 
 
 		 646 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  33.42 
 
 		 533 aa  189  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  34.54 
 
 		 539 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  34.67 
 
 		 531 aa  189  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 754 aa  189  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 662 aa  188  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 789 aa  188  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 789 aa  188  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 732 aa  188  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  33.42 
 
 		 533 aa  187  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0137  sensory box histidine kinase/response regulator  33.16 
 
 		 611 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 1165 aa  187  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1307  sensory box histidine kinase/response regulator  33.16 
 
 		 611 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 887 aa  187  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 		 789 aa  187  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  32.6 
 
 		 646 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1041  sensory box histidine kinase/response regulator  33.16 
 
 		 611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 864 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2778  Signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2635  sensory box histidine kinase/response regulator  33.16 
 
 		 611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0024  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 734 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.68 
 
 		 926 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0163  sensory box histidine kinase/response regulator  32.89 
 
 		 611 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  32.66 
 
 		 529 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 575 aa  184  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 889 aa  184  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1764  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.92 
 
 		 701 aa  183  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 		 703 aa  183  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 916 aa  183  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5603  hypothetical protein  33.69 
 
 		 756 aa  183  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 589 aa  183  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 589 aa  183  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 1036 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  28.5 
 
 		 936 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  34.36 
 
 		 507 aa  182  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 		 926 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2172  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 658 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 946 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5580  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 699 aa  181  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0190821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 754 aa  181  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 585 aa  180  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 1050 aa  180  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4234  sensor histidine kinase  26.57 
 
 		 761 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 		 618 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 743 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0290  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 		 758 aa  179  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.312795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  32.49 
 
 		 537 aa  178  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4475  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 587 aa  179  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 589 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 589 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 727 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4107  PAS sensor protein  34.25 
 
 		 587 aa  179  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  31.01 
 
 		 691 aa  178  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2378  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 551 aa  178  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0586  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 		 913 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415477  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 1076 aa  178  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1939  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 691 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0201512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  37.04 
 
 		 858 aa  177  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 1067 aa  177  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2026  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 		 964 aa  177  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 		 588 aa  177  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 		 727 aa  177  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  31.54 
 
 		 534 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 830 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  31.99 
 
 		 812 aa  177  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 941 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  33.62 
 
 		 416 aa  176  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2443  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 657 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  32.49 
 
 		 692 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  31.14 
 
 		 949 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  31.97 
 
 		 533 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 949 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>