More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5988 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 516 aa  1004    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  41.52 
 
 		 484 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 		 469 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  42.51 
 
 		 471 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 471 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 510 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 656 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  29.26 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  31.46 
 
 		 656 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  28.99 
 
 		 581 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  29.15 
 
 		 673 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  27.83 
 
 		 517 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 491 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 655 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 586 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 548 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  30.97 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 467 aa  128  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  29.24 
 
 		 487 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  30.58 
 
 		 592 aa  127  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 592 aa  127  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  27.47 
 
 		 674 aa  126  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 378 aa  126  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 655 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  32.18 
 
 		 655 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 548 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  30.59 
 
 		 548 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 736 aa  123  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  40.1 
 
 		 710 aa  123  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 680 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 584 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3588  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 775 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  36.51 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  34.78 
 
 		 363 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  30.77 
 
 		 490 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 691 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  35.94 
 
 		 712 aa  121  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  39.22 
 
 		 367 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 729 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  31.06 
 
 		 478 aa  120  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  33.33 
 
 		 484 aa  120  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 662 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 480 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 422 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  33 
 
 		 1347 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  27.6 
 
 		 647 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 630 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 528 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.828791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0496  two component sensor histidine kinase  27.02 
 
 		 481 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 438 aa  117  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  36.45 
 
 		 705 aa  117  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 488 aa  117  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 368 aa  117  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 762 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 525 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.39 
 
 		 640 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3892  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 762 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  28.49 
 
 		 468 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.72 
 
 		 542 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 689 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 725 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  29.35 
 
 		 584 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.1 
 
 		 491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  25.32 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 673 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  35.12 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  24.68 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 654 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6820  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 532 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 526 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  24.68 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 720 aa  114  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.916012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  30.51 
 
 		 501 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3818  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 468 aa  114  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.634058  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  32.79 
 
 		 458 aa  114  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  34.08 
 
 		 458 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  24.6 
 
 		 458 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  29.85 
 
 		 481 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  29.43 
 
 		 481 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  24.6 
 
 		 458 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  26.18 
 
 		 467 aa  113  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  24.6 
 
 		 458 aa  113  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1470  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 755 aa  113  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.797654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  34.08 
 
 		 465 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  24.27 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  34.53 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  31.66 
 
 		 502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  24.27 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.17 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  29.51 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  24.27 
 
 		 458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  34.97 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  25 
 
 		 542 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 372 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>