More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4246 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  97.17 
 
 
471 aa  755    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  96.76 
 
 
471 aa  759    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
469 aa  876    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  78.46 
 
 
484 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 
516 aa  260  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  36.09 
 
 
490 aa  149  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 
689 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
488 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0884  histidine kinase  40.74 
 
 
454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.456358  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
510 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3109  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
448 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 
449 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.749105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3303  histidine kinase  40.76 
 
 
449 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0834  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
439 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
656 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  29.57 
 
 
656 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
467 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
458 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.464381  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3269  sensor protein  30.4 
 
 
619 aa  133  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
548 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1715  sensor histidine kinase  31.44 
 
 
517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.443764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  25.74 
 
 
581 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1277  histidine kinase  38.57 
 
 
248 aa  130  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.838322  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
390 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1650  histidine kinase  28.41 
 
 
612 aa  127  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
515 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  29.79 
 
 
430 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  32.16 
 
 
548 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 
594 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  36.84 
 
 
613 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
491 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303105  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
564 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
476 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  33.87 
 
 
412 aa  124  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
548 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
680 aa  123  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 
490 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0625173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
378 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  34.98 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
491 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  31.28 
 
 
608 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
655 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0301  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
562 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  31.28 
 
 
608 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.28 
 
 
608 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  30.03 
 
 
584 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  31.28 
 
 
608 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  31.28 
 
 
608 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  31.28 
 
 
608 aa  121  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1110  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
508 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230539  normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.83 
 
 
578 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.03 
 
 
490 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
516 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0323  histidine kinase  38.67 
 
 
490 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.449634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0096  histidine kinase  25.82 
 
 
525 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2898  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
498 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  31.61 
 
 
560 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.94 
 
 
598 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  27.64 
 
 
1230 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2555  histidine kinase  32.62 
 
 
635 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  36.06 
 
 
617 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 
671 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  29.43 
 
 
655 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
498 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
655 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2957  sensor histidine kinase  30.13 
 
 
506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.882031  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
515 aa  117  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283678  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  38.91 
 
 
382 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3327  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
510 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.26559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3670  sporulation kinase A  29.84 
 
 
510 aa  117  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.825905  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.67 
 
 
679 aa  117  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2530  histidine kinase  38.3 
 
 
379 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266857  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
631 aa  117  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  37.64 
 
 
506 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3674  sporulation kinase A  29.84 
 
 
510 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.123371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  29.49 
 
 
468 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
339 aa  116  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  36.79 
 
 
705 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1658  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.36 
 
 
579 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0362267  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
855 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  32.04 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  31.6 
 
 
442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  27.46 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
581 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  27.38 
 
 
499 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
506 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  32.16 
 
 
470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0496  two component sensor histidine kinase  25.88 
 
 
481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2752  histidine kinase  27.39 
 
 
460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  27.74 
 
 
438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>