More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6820 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6820  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
532 aa  1050    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.79 
 
 
516 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.79 
 
 
516 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 
518 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0604  histidine kinase  34.58 
 
 
516 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
594 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
662 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  37.85 
 
 
573 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  32.28 
 
 
673 aa  156  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  34.44 
 
 
501 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2085  ATP-binding region ATPase domain protein  30.63 
 
 
510 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.158999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
671 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  32.46 
 
 
661 aa  153  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  37.5 
 
 
581 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
581 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
655 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
630 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  33.76 
 
 
500 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
654 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
661 aa  147  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 
559 aa  147  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  30.67 
 
 
581 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
581 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
570 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
494 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
378 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
592 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2491  histidine kinase  34.86 
 
 
626 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  42.21 
 
 
367 aa  143  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  34.21 
 
 
1347 aa  143  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  31.35 
 
 
592 aa  143  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
502 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  28.66 
 
 
517 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  34.1 
 
 
502 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  29.62 
 
 
487 aa  140  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  31.7 
 
 
674 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  34.01 
 
 
234 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3869  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.18 
 
 
611 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.793663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  30.56 
 
 
468 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
491 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
832 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
672 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
540 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.76 
 
 
598 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
490 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0625173  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  39.18 
 
 
419 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  36.25 
 
 
313 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.77 
 
 
457 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3785  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.9 
 
 
611 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.862005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  37.74 
 
 
369 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4055  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
586 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.174789 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
473 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  34.87 
 
 
621 aa  136  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  29.35 
 
 
600 aa  136  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  31 
 
 
499 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  30.15 
 
 
647 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2532  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
582 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  36.95 
 
 
614 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3099  sensor histidine kinase  32.63 
 
 
591 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.564011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  31.23 
 
 
672 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
689 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  35.83 
 
 
617 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
970 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
655 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1327  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
375 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2628  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
375 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
588 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
566 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
542 aa  134  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
364 aa  133  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3728  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.35 
 
 
613 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  32.46 
 
 
484 aa  133  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0824  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.33 
 
 
616 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125796 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
576 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
801 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
610 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
498 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
581 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  29.3 
 
 
542 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2555  histidine kinase  29.32 
 
 
635 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  30 
 
 
655 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0301  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
562 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
396 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
737 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  33.33 
 
 
600 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
691 aa  130  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
368 aa  130  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
488 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
1519 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
492 aa  129  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
680 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>