More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4068 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.93 
 
 		 456 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.53289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4068  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 463 aa  952    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.57 
 
 		 457 aa  617  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  66.3 
 
 		 454 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3155  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  65.57 
 
 		 555 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0867  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  65.79 
 
 		 555 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3256  ATPase domain-containing protein  66.1 
 
 		 551 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3688  nitrogen regulation protein NtrY, putative  64.47 
 
 		 555 aa  531  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.32 
 
 		 562 aa  528  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.41 
 
 		 562 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1023  histidine kinase  65.26 
 
 		 562 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.26 
 
 		 562 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1035  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.76 
 
 		 562 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.32 
 
 		 451 aa  511  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2846  ATP-binding region, ATPase-like protein  56.89 
 
 		 452 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2860  ATP-binding region, ATPase-like protein  54.85 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3506  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 450 aa  296  5e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996611 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0577  sensor histidine kinase  40.57 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122175  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2122  sensor histidine kinase  29.72 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 448 aa  150  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589471 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0098  histidine kinase  27.52 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 426 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.035298  normal  0.857551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5615  histidine kinase  26.59 
 
 		 429 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0779  sensor histidine kinase  28.87 
 
 		 468 aa  143  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0305  glycine cleavage system T protein  27.48 
 
 		 448 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724107 
 
 
-
 
NC_002950  PG0746  sensor histidine kinase  26.7 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 441 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18234  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0326  response regulator receiver domain-containing protein  24.48 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159286  normal  0.343021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 		 446 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  25.82 
 
 		 759 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 759 aa  120  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 710 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4705  sensory box sensor histidine kinase  25.28 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4582  histidine kinase  24.62 
 
 		 455 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4419  sensor histidine kinase  25.74 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  25.75 
 
 		 767 aa  114  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 		 708 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 744 aa  112  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 749 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 779 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 755 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 753 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 756 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 729 aa  107  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 		 756 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 		 737 aa  106  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 757 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1838  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 		 764 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 757 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.203555  normal  0.0623449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2579  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 761 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838184  normal  0.345494 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 756 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 769 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 		 753 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 752 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 		 733 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.35 
 
 		 800 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0017  sensor histidine kinase  24.94 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.428126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 		 738 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1446  nitrogen regulatory signal transduction histidine kinase NtrY  24.27 
 
 		 766 aa  100  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2591  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 762 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.682378  normal  0.0198144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.62 
 
 		 784 aa  98.2  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 742 aa  98.2  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0352  sensor kinase protein  23.21 
 
 		 787 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.452742  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.25 
 
 		 770 aa  97.8  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0167  sensor histidine kinase  23.21 
 
 		 802 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0157  sensor histidine kinase  23.21 
 
 		 802 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278492  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 733 aa  97.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 745 aa  97.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4410  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  22.17 
 
 		 800 aa  97.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  28.27 
 
 		 705 aa  97.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  23.52 
 
 		 734 aa  96.3  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.35 
 
 		 799 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2359  putative nitrogen regulation protein NtrY  22.99 
 
 		 802 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252159  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 753 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 754 aa  95.5  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187529  normal  0.0210363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.85 
 
 		 753 aa  95.5  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0148  nitrogen regulation protein NtrY, putative  22.99 
 
 		 806 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 576 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  22.76 
 
 		 712 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 780 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 526 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3059  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.67 
 
 		 800 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.510583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2799  putative nitrogen regulation protein NtrY  22.99 
 
 		 802 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2281  putative nitrogen regulation protein NtrY  22.99 
 
 		 802 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0640916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 764 aa  94.4  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.78 
 
 		 803 aa  94  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 718 aa  93.6  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4526  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 772 aa  94  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3176  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.77 
 
 		 804 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  25.68 
 
 		 611 aa  93.6  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0704  sensor histidine kinase  24.52 
 
 		 713 aa  92.4  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.2301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  22.68 
 
 		 752 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000619377  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2081  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 		 816 aa  92.8  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0134  nitrogen regulation protein NtrY, putative  22.77 
 
 		 787 aa  92.8  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.822432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.27 
 
 		 804 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.27 
 
 		 804 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.537383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>