More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5615 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5615  histidine kinase  100 
 
 		 429 aa  873    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.86 
 
 		 426 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.035298  normal  0.857551 
 
 
-
 
NC_002950  PG0746  sensor histidine kinase  33.25 
 
 		 455 aa  237  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 562 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 562 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1023  histidine kinase  27.87 
 
 		 562 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0867  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 555 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 562 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3256  ATPase domain-containing protein  27.84 
 
 		 551 aa  149  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 451 aa  149  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2846  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.46 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1035  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 562 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3155  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 555 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.53289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3688  nitrogen regulation protein NtrY, putative  27.49 
 
 		 555 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4068  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2860  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.95 
 
 		 437 aa  143  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0098  histidine kinase  28.03 
 
 		 439 aa  136  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0577  sensor histidine kinase  25.46 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122175  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 494 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3506  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996611 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2122  sensor histidine kinase  25.4 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 737 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0779  sensor histidine kinase  25 
 
 		 468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0326  response regulator receiver domain-containing protein  26.65 
 
 		 450 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159286  normal  0.343021 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0305  glycine cleavage system T protein  24.02 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 		 755 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 689 aa  104  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.31 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  24.6 
 
 		 748 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 461 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.62 
 
 		 756 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.73 
 
 		 756 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.2 
 
 		 731 aa  96.7  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  22.89 
 
 		 705 aa  96.3  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 		 526 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.28 
 
 		 738 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  25.59 
 
 		 767 aa  94  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 469 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  28.9 
 
 		 367 aa  93.2  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 527 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.94 
 
 		 744 aa  93.2  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 543 aa  93.2  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.63 
 
 		 736 aa  92.8  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 515 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 753 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.9 
 
 		 770 aa  92.4  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 740 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.95 
 
 		 759 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 752 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  29.96 
 
 		 1092 aa  92.4  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 449 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.749105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.78 
 
 		 524 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 662 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.72 
 
 		 733 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4582  histidine kinase  22.54 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  29.87 
 
 		 647 aa  90.9  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3303  histidine kinase  30 
 
 		 449 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146833  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.5 
 
 		 729 aa  90.9  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0017  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 445 aa  90.5  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.428126 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 471 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 779 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6820  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 532 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  22.49 
 
 		 710 aa  90.1  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 513 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.05 
 
 		 800 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.88 
 
 		 765 aa  89.7  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.26 
 
 		 541 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.28 
 
 		 765 aa  89.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.153032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  29.95 
 
 		 506 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  31.1 
 
 		 471 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0039  histidine kinase  32.52 
 
 		 655 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 753 aa  89.4  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.24 
 
 		 756 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4705  sensory box sensor histidine kinase  22.86 
 
 		 472 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.94 
 
 		 718 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3109  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2603  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.32 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.19 
 
 		 764 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2591  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 762 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.682378  normal  0.0198144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 634 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 		 763 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.14 
 
 		 655 aa  87.8  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0478  histidine kinase  27.9 
 
 		 555 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 515 aa  87.8  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 513 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2985  histidine kinase  27.56 
 
 		 498 aa  87.8  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 753 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 790 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 		 762 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.52 
 
 		 757 aa  87.8  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.203555  normal  0.0623449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 		 753 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  28.07 
 
 		 584 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>