More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3360 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 454 aa  918    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.95 
 
 		 456 aa  648    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.53289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4068  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.3 
 
 		 463 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.41 
 
 		 457 aa  597  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3256  ATPase domain-containing protein  67.9 
 
 		 551 aa  553  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3155  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  68.33 
 
 		 555 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0867  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  68.58 
 
 		 555 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.53 
 
 		 562 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.42 
 
 		 562 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.27 
 
 		 562 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1023  histidine kinase  69.01 
 
 		 562 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1035  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.53 
 
 		 562 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3688  nitrogen regulation protein NtrY, putative  67.99 
 
 		 555 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  56.96 
 
 		 451 aa  512  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2846  ATP-binding region, ATPase-like protein  60.95 
 
 		 452 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2860  ATP-binding region, ATPase-like protein  57 
 
 		 437 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3506  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 		 450 aa  299  8e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.996611 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0577  sensor histidine kinase  39.02 
 
 		 433 aa  266  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122175  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0098  histidine kinase  29.11 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589471 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2122  sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 447 aa  153  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 426 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.035298  normal  0.857551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0779  sensor histidine kinase  28.75 
 
 		 468 aa  139  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 446 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 494 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5615  histidine kinase  27.16 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0305  glycine cleavage system T protein  28.07 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 729 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 		 733 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0746  sensor histidine kinase  26.2 
 
 		 455 aa  120  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4419  sensor histidine kinase  26.88 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0326  response regulator receiver domain-containing protein  26.5 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159286  normal  0.343021 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 749 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 		 759 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 710 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4705  sensory box sensor histidine kinase  25.71 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4582  histidine kinase  26.79 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  31.35 
 
 		 550 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0017  sensor histidine kinase  24.87 
 
 		 445 aa  108  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.428126 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.28 
 
 		 547 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 		 744 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 733 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 708 aa  106  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  28.93 
 
 		 705 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  24.16 
 
 		 759 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  26.85 
 
 		 767 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  29.02 
 
 		 611 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  28.89 
 
 		 573 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 736 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 		 741 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 526 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 		 780 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 752 aa  100  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  24.19 
 
 		 712 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 		 525 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 800 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 753 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 		 737 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4410  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 800 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  28.7 
 
 		 581 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2075  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 		 770 aa  98.2  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.72 
 
 		 725 aa  98.2  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 848 aa  97.8  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 857 aa  98.2  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.897717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 		 740 aa  97.8  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 581 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 		 765 aa  97.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2175  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 838 aa  97.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2855  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 599 aa  97.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 525 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2126  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 848 aa  96.7  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 		 856 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00464627  hitchhiker  0.00534062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.93 
 
 		 538 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 736 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  24.12 
 
 		 734 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 769 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1968  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  23.32 
 
 		 933 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 784 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 756 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 764 aa  95.1  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.866376 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 838 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.05 
 
 		 773 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 738 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 764 aa  94.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.42 
 
 		 546 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 		 873 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0861202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 		 731 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0704  sensor histidine kinase  24.63 
 
 		 713 aa  94.4  4e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.2301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 838 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2156  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 838 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.494862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2138  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 838 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.82 
 
 		 926 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0148  nitrogen regulation protein NtrY, putative  23.83 
 
 		 806 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155051  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2359  putative nitrogen regulation protein NtrY  23.83 
 
 		 802 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252159  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2281  putative nitrogen regulation protein NtrY  23.83 
 
 		 802 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0640916  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 742 aa  94  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>