More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1030 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1030  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
560 aa  1116    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  35.7 
 
 
566 aa  279  1e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 
572 aa  277  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  36.3 
 
 
566 aa  276  6e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  34.55 
 
 
566 aa  270  4e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  31.37 
 
 
631 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  33.8 
 
 
559 aa  266  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  35.03 
 
 
584 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  33.5 
 
 
612 aa  258  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  32.66 
 
 
610 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  34.67 
 
 
601 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  33.8 
 
 
582 aa  253  6e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  29.09 
 
 
623 aa  252  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  29.9 
 
 
617 aa  252  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  34.76 
 
 
620 aa  251  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  35.42 
 
 
560 aa  250  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  33.45 
 
 
586 aa  250  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  34.02 
 
 
557 aa  249  9e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  34.6 
 
 
607 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  33.5 
 
 
607 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  32.95 
 
 
605 aa  246  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  33.72 
 
 
608 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  32.35 
 
 
622 aa  246  9e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 
595 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 
595 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  31.16 
 
 
629 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  30.25 
 
 
610 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  33.02 
 
 
623 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  32.24 
 
 
603 aa  244  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  30.42 
 
 
632 aa  243  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  31.64 
 
 
608 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  36.06 
 
 
611 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  32.91 
 
 
648 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  34.59 
 
 
565 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  30.22 
 
 
628 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  32.48 
 
 
645 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  32.71 
 
 
629 aa  239  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  32.18 
 
 
625 aa  237  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  32.23 
 
 
633 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  31.81 
 
 
635 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  31.3 
 
 
628 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  30.76 
 
 
608 aa  237  5.0000000000000005e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  32.02 
 
 
632 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  32.39 
 
 
632 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  31.75 
 
 
633 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  32.39 
 
 
633 aa  236  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  32.07 
 
 
606 aa  235  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  42.42 
 
 
640 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 
629 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  32.64 
 
 
619 aa  233  8.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  32.08 
 
 
633 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  33.61 
 
 
612 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  32.37 
 
 
599 aa  232  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  33.11 
 
 
605 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  32.89 
 
 
602 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  32.95 
 
 
611 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  33.71 
 
 
626 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  32.64 
 
 
620 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  33.06 
 
 
600 aa  232  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  29.51 
 
 
608 aa  230  4e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  32.64 
 
 
621 aa  230  5e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  42.55 
 
 
652 aa  229  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  42.81 
 
 
653 aa  229  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  32.62 
 
 
604 aa  229  9e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  31.95 
 
 
605 aa  229  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  29.2 
 
 
612 aa  228  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  31.14 
 
 
651 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  28.3 
 
 
589 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  32.18 
 
 
602 aa  226  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  32.97 
 
 
636 aa  227  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  31.54 
 
 
615 aa  226  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  29.34 
 
 
614 aa  226  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  31.31 
 
 
623 aa  226  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  31.31 
 
 
623 aa  226  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  39.83 
 
 
681 aa  226  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  42.45 
 
 
615 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  42.41 
 
 
615 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  42.41 
 
 
615 aa  225  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  32.74 
 
 
617 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  42.41 
 
 
615 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  42.45 
 
 
615 aa  225  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  42.41 
 
 
615 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4627  DNA mismatch repair protein  41.41 
 
 
618 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  42.33 
 
 
629 aa  225  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  31.99 
 
 
585 aa  225  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  32.34 
 
 
610 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  32.4 
 
 
600 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  42.41 
 
 
615 aa  225  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  42.41 
 
 
615 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3027  DNA mismatch repair protein  41.11 
 
 
650 aa  224  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0173835  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4637  DNA mismatch repair protein  41.41 
 
 
618 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000512951  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  29.97 
 
 
624 aa  224  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  30.73 
 
 
575 aa  224  3e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4777  DNA mismatch repair protein  41.41 
 
 
618 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00171491  normal  0.0289843 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4756  DNA mismatch repair protein  41.41 
 
 
618 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  31.92 
 
 
612 aa  224  4e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  33.71 
 
 
616 aa  224  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4720  DNA mismatch repair protein  41.41 
 
 
618 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  29.36 
 
 
647 aa  224  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0769  DNA mismatch repair protein MutL  31.2 
 
 
551 aa  224  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>