More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0769 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0769  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 551 aa  1096    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  50.67 
 
 		 588 aa  566  1e-160  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0599  DNA mismatch repair protein MutL  39.49 
 
 		 621 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0798741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0923  DNA mismatch repair protein MutL  35.79 
 
 		 516 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  35.66 
 
 		 516 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 		 575 aa  292  9e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 		 574 aa  292  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  32.73 
 
 		 610 aa  289  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  30.84 
 
 		 613 aa  289  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  33.57 
 
 		 565 aa  289  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  31.19 
 
 		 606 aa  286  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  31.11 
 
 		 644 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 		 608 aa  281  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  31.48 
 
 		 622 aa  279  9e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  30.3 
 
 		 624 aa  279  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  32.53 
 
 		 572 aa  279  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  33.28 
 
 		 566 aa  278  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  32.14 
 
 		 586 aa  277  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  31.3 
 
 		 632 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  30.52 
 
 		 629 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  30.03 
 
 		 611 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  30.79 
 
 		 616 aa  273  8.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 		 566 aa  272  9e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  29.09 
 
 		 630 aa  272  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  29.89 
 
 		 626 aa  272  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  33.22 
 
 		 566 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  30.18 
 
 		 605 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  29.52 
 
 		 644 aa  270  5e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  29.47 
 
 		 605 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  29.01 
 
 		 625 aa  269  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  30.02 
 
 		 603 aa  268  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  29.36 
 
 		 608 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  29.56 
 
 		 611 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  30.43 
 
 		 597 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  29.68 
 
 		 606 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  33.91 
 
 		 559 aa  267  4e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  30.42 
 
 		 589 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  30 
 
 		 612 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  30.02 
 
 		 603 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  30.1 
 
 		 597 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  30.73 
 
 		 616 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  29.22 
 
 		 630 aa  263  6.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  30.82 
 
 		 595 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  29.92 
 
 		 604 aa  262  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  28.85 
 
 		 607 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  30.02 
 
 		 602 aa  261  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  32.65 
 
 		 560 aa  261  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  29.34 
 
 		 621 aa  259  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  30.12 
 
 		 599 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  29.23 
 
 		 622 aa  259  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  30.1 
 
 		 632 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  29.1 
 
 		 611 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  30.1 
 
 		 633 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  29.57 
 
 		 633 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  31.57 
 
 		 606 aa  256  8e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  27.9 
 
 		 617 aa  256  9e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  31.48 
 
 		 614 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  28.83 
 
 		 647 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  27.64 
 
 		 612 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  32.54 
 
 		 584 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  29.26 
 
 		 601 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  28.62 
 
 		 629 aa  253  7e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  28.55 
 
 		 626 aa  253  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  28.59 
 
 		 635 aa  252  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  29.62 
 
 		 608 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  30.15 
 
 		 605 aa  251  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  28.81 
 
 		 602 aa  250  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  29.5 
 
 		 600 aa  250  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  27.8 
 
 		 615 aa  249  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  29.38 
 
 		 628 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  29.95 
 
 		 632 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  29.56 
 
 		 600 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  28.43 
 
 		 605 aa  246  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  31.65 
 
 		 582 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  28.43 
 
 		 643 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  27.7 
 
 		 660 aa  246  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  30.4 
 
 		 619 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  29.03 
 
 		 589 aa  244  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  29.93 
 
 		 585 aa  242  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  29.67 
 
 		 603 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  29.49 
 
 		 603 aa  240  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  27.97 
 
 		 644 aa  240  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  28.09 
 
 		 620 aa  239  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  28.43 
 
 		 612 aa  239  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  28.66 
 
 		 603 aa  239  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  28.41 
 
 		 598 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  27.73 
 
 		 622 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  28.46 
 
 		 645 aa  238  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  28.09 
 
 		 595 aa  236  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  28.09 
 
 		 595 aa  236  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  37.09 
 
 		 628 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  27.81 
 
 		 594 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0433  DNA mismatch repair protein MutL  31.08 
 
 		 544 aa  233  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.397658  normal  0.543427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3217  DNA mismatch repair protein MutL  41.77 
 
 		 762 aa  233  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0687703 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  38.97 
 
 		 607 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  39.27 
 
 		 608 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  28.82 
 
 		 617 aa  231  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  27.27 
 
 		 623 aa  230  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  27.27 
 
 		 623 aa  230  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  40.18 
 
 		 628 aa  229  8e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>