165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2811 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  100 
 
 		 1195 aa  2481    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1176 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1102 aa  386  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  26.43 
 
 		 1182 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  27.37 
 
 		 1230 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  25.33 
 
 		 1288 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  26.86 
 
 		 1171 aa  373  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1270 aa  360  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  25.42 
 
 		 1172 aa  351  4e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  25.73 
 
 		 1301 aa  350  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  24.81 
 
 		 1209 aa  338  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  26.54 
 
 		 1212 aa  334  6e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  26.3 
 
 		 1220 aa  328  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  26.47 
 
 		 1199 aa  327  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  25.68 
 
 		 1211 aa  323  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  25.65 
 
 		 1218 aa  311  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1173 aa  302  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  25.79 
 
 		 1173 aa  301  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  24.22 
 
 		 1164 aa  300  9e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  25.69 
 
 		 1207 aa  300  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  24.9 
 
 		 1209 aa  298  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  24.9 
 
 		 1209 aa  298  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  24.9 
 
 		 1209 aa  298  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  24.9 
 
 		 1209 aa  298  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  24.87 
 
 		 1209 aa  298  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  24.87 
 
 		 1209 aa  298  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  24.79 
 
 		 1209 aa  295  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1205 aa  292  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1208 aa  288  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  27.28 
 
 		 1209 aa  282  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  23.87 
 
 		 1179 aa  282  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  24.77 
 
 		 1204 aa  278  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1192 aa  278  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  25.59 
 
 		 1176 aa  276  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  24.73 
 
 		 1181 aa  275  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  24.77 
 
 		 1148 aa  275  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1179 aa  273  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  28.23 
 
 		 1152 aa  273  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1168 aa  271  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  23.98 
 
 		 1182 aa  268  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  30.58 
 
 		 830 aa  268  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1315 aa  266  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1313 aa  266  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  32.12 
 
 		 1313 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  32.32 
 
 		 1313 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1175 aa  265  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  32.48 
 
 		 1315 aa  262  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  31.54 
 
 		 1314 aa  261  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  31.54 
 
 		 1314 aa  261  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  31.54 
 
 		 1314 aa  261  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1297 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1297 aa  260  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1297 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1297 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1297 aa  260  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  24.44 
 
 		 1302 aa  260  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1297 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1297 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  24.67 
 
 		 1302 aa  258  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1175 aa  257  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  24.28 
 
 		 1302 aa  257  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1181 aa  257  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  22.2 
 
 		 1187 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  26.8 
 
 		 1157 aa  255  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  31.34 
 
 		 830 aa  252  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  26.57 
 
 		 1175 aa  246  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 1194 aa  243  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  32.33 
 
 		 831 aa  243  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  31.15 
 
 		 831 aa  243  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  31.86 
 
 		 831 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  23.87 
 
 		 1302 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  31.43 
 
 		 831 aa  239  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  23.86 
 
 		 1268 aa  225  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  24.73 
 
 		 1302 aa  224  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  23.78 
 
 		 1329 aa  224  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  24.82 
 
 		 1302 aa  221  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1008 aa  219  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1208 aa  218  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  22.89 
 
 		 1165 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2501  type VI secretion protein IcmF  23.07 
 
 		 1268 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.761474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  21.99 
 
 		 1165 aa  209  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  23.92 
 
 		 1289 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  22.49 
 
 		 1165 aa  203  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  23.78 
 
 		 1289 aa  204  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  23.99 
 
 		 1289 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  22.67 
 
 		 1194 aa  202  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3166  hypothetical protein  33.72 
 
 		 1150 aa  201  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0274  hypothetical protein  31.5 
 
 		 1154 aa  201  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  23.23 
 
 		 1289 aa  201  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  22.2 
 
 		 1206 aa  201  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  32.53 
 
 		 1335 aa  196  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1206 aa  194  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  21.84 
 
 		 1177 aa  189  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  21.84 
 
 		 1177 aa  189  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2773  type VI secretion protein IcmF  31.78 
 
 		 1265 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.276817  normal  0.540963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0018  hypothetical protein  24 
 
 		 1204 aa  175  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2631  ImcF domain-containing protein  28.89 
 
 		 1267 aa  174  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3091  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1267 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  22.76 
 
 		 1348 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  22.03 
 
 		 1174 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>