165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42900 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  58.91 
 
 		 1168 aa  1396    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  78.64 
 
 		 1192 aa  1889    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  76.68 
 
 		 1179 aa  1851    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  100 
 
 		 1175 aa  2372    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  69.24 
 
 		 1179 aa  1566    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  99.15 
 
 		 1175 aa  2357    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  29.93 
 
 		 1182 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1176 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  28.33 
 
 		 1172 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  30.2 
 
 		 1171 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1181 aa  459  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1102 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1205 aa  422  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  29.24 
 
 		 1199 aa  419  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  30.37 
 
 		 1176 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1208 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  29.47 
 
 		 1209 aa  405  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  29.65 
 
 		 1175 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  30.56 
 
 		 1220 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  27.88 
 
 		 1211 aa  389  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  29.46 
 
 		 1209 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  29.54 
 
 		 1209 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  29.46 
 
 		 1209 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  29.46 
 
 		 1209 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  29.54 
 
 		 1209 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  29.54 
 
 		 1209 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  29.46 
 
 		 1209 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  29.54 
 
 		 1209 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  27.3 
 
 		 1164 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  26.1 
 
 		 1182 aa  376  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  26.6 
 
 		 1187 aa  370  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  29.91 
 
 		 1152 aa  364  5.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  27.83 
 
 		 1212 aa  363  9e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  28.55 
 
 		 1218 aa  360  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  27.95 
 
 		 1181 aa  355  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1173 aa  352  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  27.98 
 
 		 1148 aa  350  7e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  28.32 
 
 		 1173 aa  345  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  27.28 
 
 		 1302 aa  338  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  28.22 
 
 		 1157 aa  338  3.9999999999999995e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  27.22 
 
 		 1302 aa  338  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  27.14 
 
 		 1302 aa  335  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  26.88 
 
 		 1207 aa  334  6e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  28.87 
 
 		 1204 aa  331  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 1194 aa  330  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  27.24 
 
 		 1302 aa  327  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  25.9 
 
 		 1177 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  25.9 
 
 		 1177 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  27.05 
 
 		 1302 aa  314  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  25.99 
 
 		 1302 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  26.05 
 
 		 1165 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1195 aa  302  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1008 aa  300  9e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  25.46 
 
 		 1165 aa  298  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1174 aa  299  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  27.41 
 
 		 1194 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1174 aa  295  5e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  27.06 
 
 		 1289 aa  294  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  25.46 
 
 		 1165 aa  293  9e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  27.06 
 
 		 1289 aa  292  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  27.06 
 
 		 1289 aa  293  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1206 aa  290  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  26.9 
 
 		 1289 aa  290  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  26.8 
 
 		 1206 aa  288  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  27.42 
 
 		 1205 aa  285  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  25.77 
 
 		 1268 aa  281  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1208 aa  281  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  24.96 
 
 		 1329 aa  279  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  26.18 
 
 		 1153 aa  278  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1153 aa  275  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  26.02 
 
 		 1317 aa  269  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  25.06 
 
 		 1348 aa  266  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  24.61 
 
 		 1365 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1332 aa  258  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  25.65 
 
 		 1366 aa  258  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  23.84 
 
 		 1275 aa  252  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1275 aa  252  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  23.57 
 
 		 1288 aa  238  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  26.08 
 
 		 1365 aa  237  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  22.75 
 
 		 1164 aa  237  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1369 aa  237  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1164 aa  237  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000435  IcmF-related protein  23.23 
 
 		 1130 aa  233  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.127342  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05857  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1129 aa  233  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1270 aa  232  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  23.54 
 
 		 1301 aa  225  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  24.11 
 
 		 1230 aa  221  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1297 aa  221  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1297 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1297 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1297 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1297 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1297 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1297 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  23.75 
 
 		 1150 aa  210  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  25.24 
 
 		 1358 aa  207  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  30.12 
 
 		 830 aa  207  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  25.15 
 
 		 1358 aa  207  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  25.15 
 
 		 1358 aa  206  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0500  hypothetical protein  22.02 
 
 		 973 aa  195  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>