159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3720 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  39.1 
 
 		 1206 aa  801    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1153 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  39.37 
 
 		 1208 aa  844    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  37.4 
 
 		 1165 aa  774    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  36.2 
 
 		 1153 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  37.39 
 
 		 1165 aa  793    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  36.69 
 
 		 1177 aa  791    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  40.24 
 
 		 1205 aa  755    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  37.29 
 
 		 1165 aa  768    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 1194 aa  2429    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  38.78 
 
 		 1194 aa  773    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  44.58 
 
 		 1187 aa  1085    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  36.35 
 
 		 1174 aa  729    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  44.52 
 
 		 1008 aa  912    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  39.02 
 
 		 1206 aa  797    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  41.12 
 
 		 1182 aa  996    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1174 aa  725    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  36.69 
 
 		 1177 aa  791    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  27.81 
 
 		 1171 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  25.94 
 
 		 1172 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1176 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1181 aa  364  6e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  27.29 
 
 		 1102 aa  355  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  26.61 
 
 		 1199 aa  335  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  26.24 
 
 		 1209 aa  331  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1208 aa  330  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  25.98 
 
 		 1209 aa  328  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  25.98 
 
 		 1209 aa  328  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  25.98 
 
 		 1209 aa  327  9e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  25.98 
 
 		 1209 aa  327  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  25.98 
 
 		 1209 aa  327  9e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  25.98 
 
 		 1209 aa  327  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  25.98 
 
 		 1209 aa  327  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  26.77 
 
 		 1209 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1192 aa  322  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1179 aa  322  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  26.19 
 
 		 1179 aa  318  6e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  27.88 
 
 		 1220 aa  316  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  26.65 
 
 		 1212 aa  314  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1175 aa  313  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1168 aa  313  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1175 aa  308  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  25.3 
 
 		 1182 aa  307  8.000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1205 aa  305  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  27.76 
 
 		 1218 aa  303  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  26.22 
 
 		 1181 aa  301  6e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000435  IcmF-related protein  23.97 
 
 		 1130 aa  297  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.127342  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  26.93 
 
 		 1175 aa  292  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  26.02 
 
 		 1211 aa  290  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05857  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1129 aa  285  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  24.33 
 
 		 1164 aa  273  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1195 aa  264  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  25.29 
 
 		 1157 aa  263  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  25.38 
 
 		 1148 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  24.25 
 
 		 1207 aa  251  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  25.04 
 
 		 1268 aa  251  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  23.59 
 
 		 1329 aa  241  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  24.69 
 
 		 1302 aa  234  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  25.73 
 
 		 1302 aa  226  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  29.06 
 
 		 1204 aa  224  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  24.21 
 
 		 1302 aa  215  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1173 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  25.39 
 
 		 1152 aa  214  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  24.62 
 
 		 1173 aa  214  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  24.21 
 
 		 1302 aa  214  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  23.99 
 
 		 1302 aa  213  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  23.17 
 
 		 1348 aa  212  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  24.37 
 
 		 1302 aa  209  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  25.31 
 
 		 1365 aa  206  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  24.84 
 
 		 1365 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  24.77 
 
 		 1317 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1369 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  22.74 
 
 		 1230 aa  196  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  25.35 
 
 		 1366 aa  187  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0500  hypothetical protein  22.67 
 
 		 973 aa  187  9e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0524  hypothetical protein  22.47 
 
 		 973 aa  186  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  28.82 
 
 		 831 aa  182  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1332 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  28.3 
 
 		 831 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  27.42 
 
 		 831 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  27.42 
 
 		 831 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  27.68 
 
 		 1288 aa  172  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  26.94 
 
 		 830 aa  170  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  25.31 
 
 		 1358 aa  171  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  25.33 
 
 		 1358 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  25.24 
 
 		 1358 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  28.12 
 
 		 1301 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1297 aa  166  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1297 aa  166  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1315 aa  166  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1297 aa  166  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1297 aa  166  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1297 aa  166  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1297 aa  166  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1297 aa  166  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  26.44 
 
 		 830 aa  163  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  28.32 
 
 		 1315 aa  161  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  28.1 
 
 		 1313 aa  161  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  28.1 
 
 		 1313 aa  160  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  27.88 
 
 		 1314 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>