166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1209 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  36.29 
 
 		 1206 aa  771    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1208 aa  785    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  36.36 
 
 		 1165 aa  794    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  36.56 
 
 		 1174 aa  774    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  37.97 
 
 		 1205 aa  759    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  36.16 
 
 		 1153 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 1194 aa  976    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  36.56 
 
 		 1174 aa  772    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  36.76 
 
 		 1177 aa  813    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  37.79 
 
 		 1165 aa  820    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  37.15 
 
 		 1194 aa  769    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  54.54 
 
 		 1187 aa  1410    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  37.12 
 
 		 1165 aa  799    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  64.92 
 
 		 1008 aa  1409    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  37.05 
 
 		 1206 aa  772    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  36.33 
 
 		 1153 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  100 
 
 		 1182 aa  2420    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  36.76 
 
 		 1177 aa  813    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1176 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1208 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  27.24 
 
 		 1171 aa  400  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  26.88 
 
 		 1209 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1102 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  26.59 
 
 		 1209 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  27 
 
 		 1209 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  26.59 
 
 		 1209 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  26.59 
 
 		 1209 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  26.59 
 
 		 1209 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  26.59 
 
 		 1209 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  26.59 
 
 		 1209 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  26.49 
 
 		 1172 aa  379  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  26.47 
 
 		 1209 aa  367  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  26.91 
 
 		 1199 aa  364  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1205 aa  357  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  26.27 
 
 		 1218 aa  350  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  26.69 
 
 		 1179 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  26.25 
 
 		 1220 aa  344  5.999999999999999e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1192 aa  340  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1175 aa  337  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1168 aa  335  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1179 aa  334  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1175 aa  332  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  25.95 
 
 		 1212 aa  328  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1181 aa  327  6e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  26.97 
 
 		 1182 aa  327  7e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  26.59 
 
 		 1211 aa  323  9.000000000000001e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  24.83 
 
 		 1164 aa  318  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  25.36 
 
 		 1152 aa  311  4e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  25.27 
 
 		 1181 aa  310  9e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  25.36 
 
 		 1268 aa  308  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  25.47 
 
 		 1207 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  25.34 
 
 		 1148 aa  298  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  25.39 
 
 		 1176 aa  294  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  25.3 
 
 		 1204 aa  293  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  25.43 
 
 		 1302 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  25.18 
 
 		 1302 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  25.14 
 
 		 1302 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  25.02 
 
 		 1157 aa  284  6.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  25.51 
 
 		 1302 aa  283  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000435  IcmF-related protein  24.19 
 
 		 1130 aa  282  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.127342  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  25.08 
 
 		 1302 aa  280  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05857  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1129 aa  279  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  23.91 
 
 		 1329 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  25.45 
 
 		 1173 aa  275  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1369 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1173 aa  271  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1195 aa  270  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  24.11 
 
 		 1302 aa  268  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  23.11 
 
 		 1365 aa  261  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  24.36 
 
 		 1317 aa  255  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  24.18 
 
 		 1289 aa  245  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  24.06 
 
 		 1289 aa  244  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  24.04 
 
 		 1289 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  24.09 
 
 		 1289 aa  243  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1332 aa  241  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  23.07 
 
 		 1348 aa  238  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0017  IcmF-related protein  60.12 
 
 		 173 aa  234  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  26.09 
 
 		 1175 aa  234  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  25.26 
 
 		 1365 aa  228  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  23.37 
 
 		 1358 aa  225  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  23.37 
 
 		 1358 aa  220  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  23.3 
 
 		 1358 aa  218  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  22.85 
 
 		 1275 aa  211  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  22.85 
 
 		 1275 aa  211  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  24.3 
 
 		 1366 aa  209  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1270 aa  194  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  21.26 
 
 		 1288 aa  189  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  21.92 
 
 		 1150 aa  176  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  25.55 
 
 		 831 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  20.88 
 
 		 1230 aa  174  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  25.82 
 
 		 831 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  27.24 
 
 		 830 aa  170  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  25.57 
 
 		 831 aa  167  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  25.57 
 
 		 831 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  25.16 
 
 		 830 aa  166  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0500  hypothetical protein  21.98 
 
 		 973 aa  151  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0524  hypothetical protein  21.75 
 
 		 973 aa  148  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1313 aa  146  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  26.35 
 
 		 1314 aa  145  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  26.35 
 
 		 1314 aa  145  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>