164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4923 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  68.87 
 
 		 1313 aa  1780    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  84.72 
 
 		 1297 aa  2179    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  100 
 
 		 1288 aa  2632    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  55.02 
 
 		 1270 aa  1422    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  84.72 
 
 		 1297 aa  2178    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  82.03 
 
 		 1313 aa  2123    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  49.92 
 
 		 1230 aa  1236    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  81.85 
 
 		 1315 aa  2151    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  83.28 
 
 		 1301 aa  2152    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  81.92 
 
 		 1314 aa  2136    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  82.11 
 
 		 1313 aa  2122    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  81.92 
 
 		 1314 aa  2136    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  81.85 
 
 		 1314 aa  2135    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  84.72 
 
 		 1297 aa  2179    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  84.72 
 
 		 1297 aa  2179    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  84.72 
 
 		 1297 aa  2178    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  84.72 
 
 		 1297 aa  2179    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  83.07 
 
 		 1315 aa  2142    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  84.72 
 
 		 1297 aa  2179    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3091  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1267 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2773  type VI secretion protein IcmF  26 
 
 		 1265 aa  406  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.276817  normal  0.540963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2631  ImcF domain-containing protein  25.32 
 
 		 1267 aa  406  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2501  type VI secretion protein IcmF  25.94 
 
 		 1268 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.761474 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1195 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1176 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  26.38 
 
 		 1199 aa  327  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  25.49 
 
 		 1212 aa  325  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1205 aa  318  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1102 aa  317  9e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  32.96 
 
 		 831 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  24.44 
 
 		 1182 aa  308  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  31.91 
 
 		 831 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  30.46 
 
 		 830 aa  304  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  32.33 
 
 		 831 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  32.49 
 
 		 831 aa  301  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  31.21 
 
 		 830 aa  301  6e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  27.91 
 
 		 1211 aa  296  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  28.83 
 
 		 1209 aa  294  8e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  29.08 
 
 		 1209 aa  292  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  29.08 
 
 		 1209 aa  292  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  29.08 
 
 		 1209 aa  292  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  29.08 
 
 		 1209 aa  292  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  29.08 
 
 		 1209 aa  292  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  29.08 
 
 		 1209 aa  291  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  29.08 
 
 		 1209 aa  291  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1208 aa  289  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  26.63 
 
 		 1220 aa  289  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  26.17 
 
 		 1171 aa  287  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  25.53 
 
 		 1209 aa  286  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  25.43 
 
 		 1207 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  29.92 
 
 		 1218 aa  271  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  23.38 
 
 		 1172 aa  268  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  27.76 
 
 		 1152 aa  255  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1181 aa  253  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  26.08 
 
 		 1181 aa  250  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  26.2 
 
 		 1164 aa  243  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  32.45 
 
 		 1335 aa  237  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  24.84 
 
 		 1329 aa  234  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  31.63 
 
 		 1173 aa  229  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  33.41 
 
 		 1173 aa  228  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  25.1 
 
 		 1204 aa  226  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  26.47 
 
 		 1157 aa  224  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  34.13 
 
 		 1302 aa  222  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  33.69 
 
 		 1302 aa  222  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  34.13 
 
 		 1302 aa  223  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1179 aa  219  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  30.77 
 
 		 1148 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  35.85 
 
 		 1176 aa  218  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0274  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1154 aa  215  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1168 aa  215  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4962  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1310 aa  212  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1175 aa  211  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0018  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1204 aa  211  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1192 aa  208  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5271  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1156 aa  207  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 1302 aa  207  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  26.27 
 
 		 1302 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0633  ImcF-like protein  25.73 
 
 		 1115 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.201654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  22.41 
 
 		 1206 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  25.28 
 
 		 1179 aa  196  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  22.01 
 
 		 1187 aa  196  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  33.88 
 
 		 1175 aa  195  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  21.56 
 
 		 1206 aa  193  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1208 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  25.18 
 
 		 1348 aa  192  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  31.83 
 
 		 1289 aa  192  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  31.83 
 
 		 1289 aa  191  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  31.83 
 
 		 1289 aa  191  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3655  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1272 aa  191  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.851877 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  31.83 
 
 		 1289 aa  191  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3166  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1150 aa  190  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  21.7 
 
 		 1182 aa  189  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1275 aa  179  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  23.37 
 
 		 1275 aa  179  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  22.16 
 
 		 1194 aa  178  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  23.65 
 
 		 1150 aa  178  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  29.53 
 
 		 1302 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  22.06 
 
 		 1177 aa  174  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  22.06 
 
 		 1177 aa  174  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1008 aa  169  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>