160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2262 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4962  hypothetical protein  44.2 
 
 
1310 aa  1085    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  100 
 
 
1335 aa  2702    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3091  hypothetical protein  46.12 
 
 
1267 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2773  type VI secretion protein IcmF  47.12 
 
 
1265 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.276817  normal  0.540963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2631  ImcF domain-containing protein  45.97 
 
 
1267 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390277  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2501  type VI secretion protein IcmF  44.78 
 
 
1268 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.761474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  31.06 
 
 
1270 aa  240  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  32.24 
 
 
1288 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  31.21 
 
 
1315 aa  236  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  31.91 
 
 
1230 aa  232  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  30.99 
 
 
1313 aa  229  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  31.7 
 
 
1176 aa  229  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  32.8 
 
 
1315 aa  228  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  31.35 
 
 
1313 aa  227  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  32.69 
 
 
1301 aa  226  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  31.52 
 
 
831 aa  226  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  32.56 
 
 
1297 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  32.56 
 
 
1297 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  32.56 
 
 
1297 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  32.56 
 
 
1297 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  32.56 
 
 
1297 aa  223  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  32.56 
 
 
1297 aa  222  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  32.56 
 
 
1297 aa  223  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  32.77 
 
 
1314 aa  221  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  32.77 
 
 
1314 aa  221  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  32.77 
 
 
1314 aa  221  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  27.92 
 
 
830 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  32.24 
 
 
1313 aa  218  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  28.96 
 
 
831 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  30.16 
 
 
831 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  30.16 
 
 
831 aa  214  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  32.33 
 
 
1102 aa  213  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  30.21 
 
 
1172 aa  208  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  30.28 
 
 
1199 aa  207  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  30.31 
 
 
830 aa  207  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  31.89 
 
 
1171 aa  207  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3655  hypothetical protein  26.79 
 
 
1272 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.851877 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  28.99 
 
 
1182 aa  197  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  33.77 
 
 
1220 aa  195  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  32.53 
 
 
1195 aa  192  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  31.21 
 
 
1205 aa  191  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  37.84 
 
 
1173 aa  189  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  37.35 
 
 
1173 aa  189  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  28.62 
 
 
1211 aa  187  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  31.55 
 
 
1164 aa  186  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  28.31 
 
 
1212 aa  185  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  37.28 
 
 
1176 aa  185  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  31.96 
 
 
1302 aa  180  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  37.05 
 
 
1302 aa  181  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  31.96 
 
 
1302 aa  180  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  29.87 
 
 
1207 aa  179  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  26.19 
 
 
1181 aa  178  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0633  ImcF-like protein  25.22 
 
 
1115 aa  177  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.201654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  31.97 
 
 
1157 aa  176  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  29.9 
 
 
1209 aa  174  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  30.28 
 
 
1268 aa  174  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0018  hypothetical protein  24.92 
 
 
1204 aa  173  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  29.29 
 
 
1209 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  29.29 
 
 
1209 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  29.29 
 
 
1209 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  29.29 
 
 
1209 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  29.29 
 
 
1209 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  29.29 
 
 
1209 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  29.29 
 
 
1209 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  29.23 
 
 
1302 aa  170  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  32.39 
 
 
1218 aa  171  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2911  ImcF domain-containing protein  24.76 
 
 
1094 aa  171  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.951042  normal  0.253398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  27.89 
 
 
1208 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  30.04 
 
 
1209 aa  169  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  29.24 
 
 
1181 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  36.96 
 
 
1148 aa  169  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  35.82 
 
 
1302 aa  169  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  36.14 
 
 
1302 aa  168  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  32.04 
 
 
1175 aa  167  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3247  ImcF domain-containing protein  25.54 
 
 
1114 aa  165  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  33.61 
 
 
1204 aa  163  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0274  hypothetical protein  29.61 
 
 
1154 aa  160  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  30.28 
 
 
1289 aa  157  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  30.28 
 
 
1289 aa  156  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  30.28 
 
 
1289 aa  157  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  29.31 
 
 
1152 aa  156  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  30.64 
 
 
1289 aa  156  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1798  ImcF domain-containing protein  24.69 
 
 
1067 aa  151  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2495  hypothetical protein  24.77 
 
 
1140 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.963407  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5271  hypothetical protein  23.25 
 
 
1156 aa  149  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2591  ImcF domain-containing protein  24.4 
 
 
1140 aa  148  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2989  hypothetical protein  24.4 
 
 
1140 aa  148  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000392845 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0795  hypothetical protein  25.37 
 
 
1140 aa  148  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  28.65 
 
 
1208 aa  145  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  30.1 
 
 
1179 aa  144  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  30.02 
 
 
1179 aa  142  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  29.05 
 
 
1275 aa  140  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  29.05 
 
 
1275 aa  140  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  27.34 
 
 
1329 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  28.77 
 
 
1150 aa  139  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3166  hypothetical protein  29.33 
 
 
1150 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  27.97 
 
 
1206 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  27.66 
 
 
1206 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  27.63 
 
 
1194 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  29.17 
 
 
1192 aa  131  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>