165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2130 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  96.93 
 
 		 1206 aa  2300    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  81.99 
 
 		 1208 aa  1979    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  36.11 
 
 		 1187 aa  833    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  86.3 
 
 		 1194 aa  2036    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  34.45 
 
 		 1177 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  34.45 
 
 		 1177 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 1194 aa  791    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  39.49 
 
 		 1008 aa  750    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  100 
 
 		 1206 aa  2426    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  37.23 
 
 		 1182 aa  785    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  34.73 
 
 		 1165 aa  628  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  34.72 
 
 		 1165 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  34.28 
 
 		 1165 aa  610  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1174 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  33.44 
 
 		 1174 aa  571  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  33.8 
 
 		 1205 aa  567  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  33.67 
 
 		 1153 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  33.67 
 
 		 1153 aa  559  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1176 aa  353  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1102 aa  334  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  26.96 
 
 		 1171 aa  333  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1181 aa  333  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1168 aa  328  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  24.46 
 
 		 1172 aa  320  9e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  26.87 
 
 		 1199 aa  305  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  25.6 
 
 		 1212 aa  292  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1179 aa  290  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1192 aa  289  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  27.26 
 
 		 1220 aa  283  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  25.56 
 
 		 1209 aa  281  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  25.41 
 
 		 1302 aa  277  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  26.06 
 
 		 1302 aa  276  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  25.34 
 
 		 1302 aa  275  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  25.74 
 
 		 1179 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  24.96 
 
 		 1209 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  25.34 
 
 		 1302 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  25.18 
 
 		 1182 aa  275  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  24.96 
 
 		 1209 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  24.96 
 
 		 1209 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  24.96 
 
 		 1209 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  24.96 
 
 		 1209 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  24.96 
 
 		 1209 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  25.7 
 
 		 1209 aa  273  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1208 aa  271  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1205 aa  270  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  25.95 
 
 		 1209 aa  270  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  24.62 
 
 		 1211 aa  266  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  25.28 
 
 		 1302 aa  258  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  25.38 
 
 		 1302 aa  258  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1175 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1173 aa  249  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  24.69 
 
 		 1218 aa  247  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1175 aa  246  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  25.42 
 
 		 1204 aa  243  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  24.82 
 
 		 1181 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  26.26 
 
 		 1152 aa  236  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  23.56 
 
 		 1329 aa  234  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  25.08 
 
 		 1365 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  24.55 
 
 		 1207 aa  233  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000435  IcmF-related protein  22.82 
 
 		 1130 aa  232  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.127342  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  23.39 
 
 		 1164 aa  230  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05857  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1129 aa  230  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  23.71 
 
 		 1268 aa  229  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  24.2 
 
 		 1348 aa  229  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  24.47 
 
 		 1157 aa  228  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  22.98 
 
 		 1230 aa  223  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  24.59 
 
 		 1148 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  24.04 
 
 		 1365 aa  218  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1369 aa  210  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1270 aa  209  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  22.19 
 
 		 1195 aa  205  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  24.64 
 
 		 1317 aa  194  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  23.82 
 
 		 1366 aa  194  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  22.3 
 
 		 1288 aa  194  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  26.2 
 
 		 1175 aa  192  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1332 aa  189  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  21.53 
 
 		 1301 aa  181  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  23.95 
 
 		 1164 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  22.6 
 
 		 1289 aa  167  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  22.55 
 
 		 1289 aa  166  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  22.89 
 
 		 1289 aa  165  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  22.64 
 
 		 1289 aa  164  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0524  hypothetical protein  21.99 
 
 		 973 aa  155  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  24.68 
 
 		 1358 aa  155  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0500  hypothetical protein  21.78 
 
 		 973 aa  155  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  24.59 
 
 		 1358 aa  154  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  22.2 
 
 		 1150 aa  149  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  28.23 
 
 		 1173 aa  145  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  25.71 
 
 		 1176 aa  142  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  26.12 
 
 		 830 aa  140  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  27.27 
 
 		 831 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  26.82 
 
 		 831 aa  138  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  26.47 
 
 		 831 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  26.87 
 
 		 1335 aa  137  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4962  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1310 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  26.03 
 
 		 831 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1275 aa  132  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  22.94 
 
 		 1275 aa  132  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1164 aa  131  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  22.84 
 
 		 1164 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>