165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0140 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  45.67 
 
 		 1289 aa  1069    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  71.27 
 
 		 1302 aa  1889    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  46.34 
 
 		 1348 aa  1140    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  33.69 
 
 		 1275 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  71.04 
 
 		 1302 aa  1889    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  99.62 
 
 		 1302 aa  2617    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  50.24 
 
 		 1358 aa  912    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  45.08 
 
 		 1369 aa  1103    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  40.89 
 
 		 1332 aa  887    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  93.24 
 
 		 1302 aa  2382    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  36.78 
 
 		 1209 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  34.01 
 
 		 1150 aa  655    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  45.9 
 
 		 1289 aa  1068    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  45.87 
 
 		 1365 aa  1107    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  44.76 
 
 		 1329 aa  1088    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  45.59 
 
 		 1289 aa  1064    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  44.83 
 
 		 1365 aa  1090    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  39.9 
 
 		 1317 aa  839    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  44.07 
 
 		 1366 aa  1035    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  99.54 
 
 		 1302 aa  2617    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  50.24 
 
 		 1358 aa  911    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  33.69 
 
 		 1275 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  100 
 
 		 1302 aa  2624    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  49.95 
 
 		 1358 aa  908    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  35.88 
 
 		 1211 aa  681    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  47.79 
 
 		 1268 aa  1131    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  45.75 
 
 		 1289 aa  1066    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  36.78 
 
 		 1209 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  35.55 
 
 		 1208 aa  634  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  36.78 
 
 		 1209 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  36.78 
 
 		 1209 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  36.22 
 
 		 1205 aa  636  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  36.78 
 
 		 1209 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  36.78 
 
 		 1209 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  36.78 
 
 		 1209 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  36.7 
 
 		 1209 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  35.35 
 
 		 1199 aa  624  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  33.7 
 
 		 1209 aa  618  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  34.61 
 
 		 1218 aa  610  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0928  SciS protein  44.91 
 
 		 890 aa  595  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1215  ImcF-like family protein  44.91 
 
 		 890 aa  595  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  35.29 
 
 		 1220 aa  592  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  33.23 
 
 		 1207 aa  566  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  32.09 
 
 		 1212 aa  568  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  32.36 
 
 		 1176 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  30.84 
 
 		 1171 aa  539  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  32.6 
 
 		 1102 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  28.18 
 
 		 1182 aa  490  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  27.51 
 
 		 1172 aa  450  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0929  SciS protein  51.81 
 
 		 431 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1216  hypothetical protein  51.81 
 
 		 431 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  30.92 
 
 		 1175 aa  416  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1181 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  28.73 
 
 		 1181 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  30.7 
 
 		 1204 aa  390  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1173 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  27.74 
 
 		 1164 aa  387  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  30.25 
 
 		 1176 aa  379  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  30.1 
 
 		 1173 aa  380  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1192 aa  332  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  27.48 
 
 		 1179 aa  321  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  28.14 
 
 		 1148 aa  318  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  26.66 
 
 		 1157 aa  308  4.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1179 aa  299  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1208 aa  298  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  24.43 
 
 		 1187 aa  298  6e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  27.76 
 
 		 1152 aa  294  8e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1175 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  25.37 
 
 		 1182 aa  287  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1206 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  25.94 
 
 		 1206 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  25.74 
 
 		 1194 aa  271  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1168 aa  265  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1195 aa  258  7e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  29.54 
 
 		 1270 aa  254  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1164 aa  251  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  28.78 
 
 		 1164 aa  250  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  23.8 
 
 		 1165 aa  238  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1008 aa  236  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  23.62 
 
 		 1177 aa  235  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  23.62 
 
 		 1177 aa  235  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  28.25 
 
 		 1288 aa  232  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  33.13 
 
 		 1315 aa  232  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  34.09 
 
 		 1314 aa  226  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  34.09 
 
 		 1314 aa  225  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  34.09 
 
 		 1314 aa  225  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  35 
 
 		 1313 aa  224  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  35 
 
 		 1313 aa  224  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  36.18 
 
 		 1315 aa  224  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  25.78 
 
 		 1230 aa  224  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  34.56 
 
 		 1301 aa  221  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  23.29 
 
 		 1165 aa  221  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  26.28 
 
 		 1205 aa  221  8.999999999999998e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  36.41 
 
 		 1297 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  36.41 
 
 		 1297 aa  220  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  36.41 
 
 		 1297 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  36.41 
 
 		 1297 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  36.41 
 
 		 1297 aa  220  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  36.41 
 
 		 1297 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  36.41 
 
 		 1297 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>