169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0399 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  100 
 
 		 1209 aa  2434    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  42.85 
 
 		 1218 aa  885    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  43.25 
 
 		 1199 aa  883    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  42.99 
 
 		 1220 aa  865    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  34.18 
 
 		 1329 aa  640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  99.75 
 
 		 1209 aa  2425    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  37.06 
 
 		 1302 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  38.35 
 
 		 1176 aa  771    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  86.51 
 
 		 1208 aa  2122    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  95.37 
 
 		 1209 aa  2281    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  53.86 
 
 		 1205 aa  1224    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  39.24 
 
 		 1102 aa  748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  52.76 
 
 		 1211 aa  1214    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  41.36 
 
 		 1207 aa  897    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  42.95 
 
 		 1209 aa  936    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  100 
 
 		 1209 aa  2434    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  100 
 
 		 1209 aa  2434    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  37.14 
 
 		 1302 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  99.92 
 
 		 1209 aa  2432    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  37.06 
 
 		 1302 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  99.92 
 
 		 1209 aa  2432    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  100 
 
 		 1209 aa  2434    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  45.4 
 
 		 1212 aa  1031    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  37.56 
 
 		 1171 aa  720    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  36.72 
 
 		 1302 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  35.63 
 
 		 1302 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  31.61 
 
 		 1182 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  33.25 
 
 		 1268 aa  602  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  33.23 
 
 		 1348 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  34.77 
 
 		 1302 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  35.13 
 
 		 1289 aa  589  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  35.1 
 
 		 1289 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  35.1 
 
 		 1289 aa  589  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  35.1 
 
 		 1289 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  30.48 
 
 		 1172 aa  559  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  34.11 
 
 		 1358 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  34.11 
 
 		 1358 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  34.04 
 
 		 1358 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1181 aa  536  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  35.27 
 
 		 1365 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  33.14 
 
 		 1175 aa  532  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  35.06 
 
 		 1365 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  33.12 
 
 		 1332 aa  522  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  31.48 
 
 		 1181 aa  512  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  34.4 
 
 		 1369 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  31.4 
 
 		 1164 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  34.47 
 
 		 1366 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  31.74 
 
 		 1317 aa  492  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  33.58 
 
 		 1176 aa  478  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  31.11 
 
 		 1157 aa  461  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  27.67 
 
 		 1275 aa  446  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  33.08 
 
 		 1152 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1275 aa  446  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  33.24 
 
 		 1204 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  32.67 
 
 		 1173 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  30.5 
 
 		 1148 aa  433  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1173 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  27.95 
 
 		 1150 aa  398  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1192 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  26.66 
 
 		 1182 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  29.52 
 
 		 1179 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1164 aa  376  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  27.47 
 
 		 1164 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  25.18 
 
 		 1187 aa  369  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1179 aa  362  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1175 aa  357  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1175 aa  353  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1168 aa  347  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 1194 aa  322  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1008 aa  321  7e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1270 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1297 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1297 aa  315  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1297 aa  315  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1297 aa  315  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1297 aa  315  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1297 aa  314  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1297 aa  314  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  27.24 
 
 		 1301 aa  314  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  26.15 
 
 		 1165 aa  313  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  25.37 
 
 		 1165 aa  311  6.999999999999999e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  26.87 
 
 		 1288 aa  308  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  25.37 
 
 		 1165 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0928  SciS protein  33.87 
 
 		 890 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1215  ImcF-like family protein  33.87 
 
 		 890 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  26.31 
 
 		 1164 aa  298  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1195 aa  298  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1208 aa  298  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1167 aa  294  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1167 aa  294  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1167 aa  294  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1167 aa  294  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  26.8 
 
 		 1230 aa  288  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1147 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  26.08 
 
 		 1206 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1206 aa  282  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  24.6 
 
 		 1177 aa  278  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  24.6 
 
 		 1177 aa  278  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  25.89 
 
 		 1194 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1104 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>