166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3846 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  36.91 
 
 
1207 aa  730    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  42.65 
 
 
1209 aa  919    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  43.45 
 
 
1205 aa  900    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  34.55 
 
 
1302 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  44.19 
 
 
1211 aa  955    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  100 
 
 
1218 aa  2474    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  42.57 
 
 
1209 aa  914    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  34.64 
 
 
1302 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  38 
 
 
1212 aa  792    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  41.12 
 
 
1208 aa  892    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  42.89 
 
 
1209 aa  928    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  43.21 
 
 
1199 aa  892    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  39.83 
 
 
1102 aa  773    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  71.72 
 
 
1209 aa  1764    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  42.65 
 
 
1209 aa  919    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  42.65 
 
 
1209 aa  919    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  34.69 
 
 
1302 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  42.65 
 
 
1209 aa  918    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  34.72 
 
 
1302 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  42.65 
 
 
1209 aa  918    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  42.65 
 
 
1209 aa  919    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  40.19 
 
 
1171 aa  805    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  41.81 
 
 
1220 aa  824    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  39.95 
 
 
1176 aa  833    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  34.48 
 
 
1302 aa  631  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  34.13 
 
 
1302 aa  619  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  33.63 
 
 
1268 aa  602  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  31.9 
 
 
1172 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  32.73 
 
 
1329 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  31.05 
 
 
1182 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  33.62 
 
 
1289 aa  572  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  33.41 
 
 
1289 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  33.18 
 
 
1289 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  33.18 
 
 
1289 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  32.04 
 
 
1348 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  31.67 
 
 
1181 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  32.92 
 
 
1175 aa  536  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  31.51 
 
 
1164 aa  512  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  29 
 
 
1181 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  33.99 
 
 
1204 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  32.96 
 
 
1176 aa  498  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  32.65 
 
 
1365 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  29.94 
 
 
1332 aa  475  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  32.44 
 
 
1365 aa  476  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  33.56 
 
 
1358 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  33.56 
 
 
1358 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  33.43 
 
 
1358 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  31.53 
 
 
1369 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  32.47 
 
 
1366 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  31.88 
 
 
1173 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  31.76 
 
 
1173 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  31.28 
 
 
1148 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  29.18 
 
 
1317 aa  452  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  31.49 
 
 
1152 aa  439  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  28.63 
 
 
1275 aa  429  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  28.63 
 
 
1275 aa  429  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  27.75 
 
 
1192 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  27.32 
 
 
1179 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  29.06 
 
 
1150 aa  379  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  27.46 
 
 
1164 aa  376  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  27.26 
 
 
1164 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  26.72 
 
 
1182 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  25.54 
 
 
1187 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  28.17 
 
 
1168 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  30.81 
 
 
1157 aa  348  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  25.65 
 
 
1195 aa  338  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  25.65 
 
 
1165 aa  310  8e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  27.18 
 
 
1194 aa  308  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  30.46 
 
 
1270 aa  302  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  25.29 
 
 
1165 aa  301  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  25.07 
 
 
1165 aa  300  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  26.78 
 
 
1288 aa  298  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  25.35 
 
 
1008 aa  293  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  26.29 
 
 
1167 aa  291  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  26.29 
 
 
1167 aa  291  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  30.91 
 
 
1179 aa  290  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0928  SciS protein  30.75 
 
 
890 aa  289  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1215  ImcF-like family protein  30.75 
 
 
890 aa  289  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  25.99 
 
 
1230 aa  288  5e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  25.04 
 
 
1177 aa  278  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  25.04 
 
 
1177 aa  278  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  29.71 
 
 
1297 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  29.71 
 
 
1297 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  29.71 
 
 
1297 aa  273  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  29.71 
 
 
1297 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  29.71 
 
 
1297 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  29.71 
 
 
1297 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  29.71 
 
 
1297 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  29.43 
 
 
1301 aa  271  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  26.46 
 
 
1205 aa  268  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  31.7 
 
 
1315 aa  268  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  25.34 
 
 
1208 aa  268  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  29.55 
 
 
1175 aa  263  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  32.08 
 
 
1313 aa  262  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  31.92 
 
 
1313 aa  261  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  25.02 
 
 
1206 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  33.94 
 
 
1315 aa  259  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  24.96 
 
 
1206 aa  258  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  31.07 
 
 
1314 aa  257  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  31.07 
 
 
1314 aa  257  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>