149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0274 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3166  hypothetical protein  69.44 
 
 		 1150 aa  1607    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3045  hypothetical protein  41.11 
 
 		 1133 aa  840    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0274  hypothetical protein  100 
 
 		 1154 aa  2331    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1205  hypothetical protein  41.95 
 
 		 1134 aa  856    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0855  putative lipoprotein  30.18 
 
 		 1296 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0883646  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0729.1  hypothetical protein  35.22 
 
 		 1525 aa  260  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0619  hypothetical protein  35.22 
 
 		 1355 aa  260  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.104026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0730  hypothetical protein  35.22 
 
 		 1322 aa  260  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224461  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1688  hypothetical protein  35.22 
 
 		 1319 aa  260  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0017  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1140 aa  257  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2040  hypothetical protein  34.73 
 
 		 1334 aa  254  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0549  hypothetical protein  34.73 
 
 		 1299 aa  254  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553275  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2138  hypothetical protein  34.93 
 
 		 1328 aa  252  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  31.28 
 
 		 1301 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1297 aa  224  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1297 aa  224  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1297 aa  224  8e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1297 aa  224  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1297 aa  224  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1297 aa  224  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1297 aa  224  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  31.61 
 
 		 1315 aa  221  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1315 aa  220  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  31.33 
 
 		 1314 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  31.33 
 
 		 1314 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  31.2 
 
 		 1313 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  31.33 
 
 		 1314 aa  219  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  30.91 
 
 		 1313 aa  218  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  31.2 
 
 		 1288 aa  218  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  34.89 
 
 		 1176 aa  217  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  33.26 
 
 		 1171 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1195 aa  213  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  36.13 
 
 		 1102 aa  213  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  36.23 
 
 		 1313 aa  208  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1270 aa  208  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  31.45 
 
 		 1230 aa  201  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  33.68 
 
 		 1172 aa  199  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  29.57 
 
 		 830 aa  199  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  34.46 
 
 		 1218 aa  195  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1205 aa  194  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  29.46 
 
 		 831 aa  194  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  32.43 
 
 		 1211 aa  192  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  29.26 
 
 		 831 aa  192  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  27.88 
 
 		 830 aa  191  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  30.85 
 
 		 1182 aa  190  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  38.81 
 
 		 1212 aa  189  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  32.92 
 
 		 1181 aa  189  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  31.68 
 
 		 1207 aa  189  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  28.74 
 
 		 831 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  29.15 
 
 		 831 aa  188  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  33.33 
 
 		 1220 aa  187  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  31.33 
 
 		 1152 aa  187  9e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  36.81 
 
 		 1204 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  34.71 
 
 		 1209 aa  186  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1208 aa  183  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  31.11 
 
 		 1209 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  30.19 
 
 		 1157 aa  177  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  32.41 
 
 		 1209 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  32.41 
 
 		 1209 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  32.41 
 
 		 1209 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  32.41 
 
 		 1209 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  33.33 
 
 		 1209 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  33.33 
 
 		 1209 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  33.33 
 
 		 1209 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  30.51 
 
 		 1199 aa  175  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  33.94 
 
 		 1176 aa  168  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  35.79 
 
 		 1173 aa  165  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  32.23 
 
 		 1148 aa  163  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  30 
 
 		 1181 aa  162  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  29.83 
 
 		 1164 aa  159  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  35.45 
 
 		 1173 aa  159  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  29.53 
 
 		 1335 aa  159  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  33.58 
 
 		 1175 aa  155  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2773  type VI secretion protein IcmF  27.1 
 
 		 1265 aa  154  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.276817  normal  0.540963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  30.17 
 
 		 1179 aa  154  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4962  hypothetical protein  29.4 
 
 		 1310 aa  151  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  29 
 
 		 1302 aa  151  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1192 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  31.23 
 
 		 1302 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  31.23 
 
 		 1302 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  27.26 
 
 		 1179 aa  147  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  31.4 
 
 		 1302 aa  142  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2631  ImcF domain-containing protein  27.56 
 
 		 1267 aa  141  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1175 aa  140  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1175 aa  140  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3091  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1267 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2501  type VI secretion protein IcmF  26.36 
 
 		 1268 aa  138  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.761474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  28.89 
 
 		 1329 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  32.74 
 
 		 1289 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  32.54 
 
 		 1289 aa  137  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  32.74 
 
 		 1289 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  32.74 
 
 		 1289 aa  136  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  33.1 
 
 		 1302 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  33.21 
 
 		 1302 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1168 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  25.2 
 
 		 1182 aa  125  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  30.54 
 
 		 1268 aa  124  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  23.67 
 
 		 1187 aa  119  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  28.12 
 
 		 1348 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  28.14 
 
 		 1150 aa  112  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>