163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA2826 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  70.45 
 
 		 1313 aa  1792    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  100 
 
 		 1297 aa  2647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  53.84 
 
 		 1270 aa  1393    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  99.85 
 
 		 1297 aa  2644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  87.77 
 
 		 1315 aa  2262    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  87.87 
 
 		 1315 aa  2279    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  97.31 
 
 		 1301 aa  2467    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  87.8 
 
 		 1314 aa  2268    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  88.2 
 
 		 1313 aa  2254    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  49.76 
 
 		 1230 aa  1238    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  87.8 
 
 		 1314 aa  2268    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  100 
 
 		 1297 aa  2647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  100 
 
 		 1297 aa  2647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  99.69 
 
 		 1297 aa  2641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  99.92 
 
 		 1297 aa  2645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  100 
 
 		 1297 aa  2647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  88.04 
 
 		 1313 aa  2259    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  87.72 
 
 		 1314 aa  2267    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  84.22 
 
 		 1288 aa  2175    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2501  type VI secretion protein IcmF  26.53 
 
 		 1268 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.761474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2631  ImcF domain-containing protein  26.2 
 
 		 1267 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3091  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1267 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2773  type VI secretion protein IcmF  26.52 
 
 		 1265 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.276817  normal  0.540963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4962  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1310 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1195 aa  356  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1205 aa  322  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  25.81 
 
 		 1199 aa  318  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  25.73 
 
 		 1211 aa  315  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  32.09 
 
 		 831 aa  312  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  32.47 
 
 		 831 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  31.91 
 
 		 831 aa  308  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  32.47 
 
 		 831 aa  307  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  31.7 
 
 		 830 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  29.44 
 
 		 1209 aa  302  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  29.44 
 
 		 1209 aa  302  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  29.44 
 
 		 1209 aa  302  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  29.44 
 
 		 1209 aa  302  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  29.99 
 
 		 830 aa  301  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  29.33 
 
 		 1209 aa  301  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  29.33 
 
 		 1209 aa  301  8e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  29.33 
 
 		 1209 aa  301  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1208 aa  298  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  29.17 
 
 		 1209 aa  298  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  26.42 
 
 		 1171 aa  292  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  24.54 
 
 		 1182 aa  291  8e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  26.17 
 
 		 1220 aa  286  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  24.9 
 
 		 1212 aa  283  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1176 aa  266  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  29.41 
 
 		 1218 aa  260  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  34.71 
 
 		 1102 aa  257  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  25.85 
 
 		 1207 aa  252  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  36.48 
 
 		 1209 aa  242  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  27.45 
 
 		 1152 aa  242  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1181 aa  241  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  29.74 
 
 		 1172 aa  239  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  32.1 
 
 		 1335 aa  234  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  32.26 
 
 		 1181 aa  233  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  24.79 
 
 		 1329 aa  231  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  35.15 
 
 		 1302 aa  229  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  35.15 
 
 		 1302 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  35.37 
 
 		 1302 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  25.99 
 
 		 1164 aa  227  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  38.6 
 
 		 1173 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  39.23 
 
 		 1176 aa  222  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0274  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1154 aa  221  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  38.3 
 
 		 1173 aa  221  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  33.33 
 
 		 1148 aa  220  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  33.48 
 
 		 1157 aa  215  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  33.04 
 
 		 1302 aa  214  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1179 aa  208  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  38.64 
 
 		 1204 aa  208  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0018  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1204 aa  208  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5271  hypothetical protein  26.59 
 
 		 1156 aa  208  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1175 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3166  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1150 aa  201  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  34.52 
 
 		 1175 aa  201  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0633  ImcF-like protein  25.24 
 
 		 1115 aa  199  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.201654 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  22.34 
 
 		 1187 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  30.87 
 
 		 1289 aa  194  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  30.87 
 
 		 1289 aa  194  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  30.87 
 
 		 1289 aa  194  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  30.87 
 
 		 1289 aa  193  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3655  hypothetical protein  25.03 
 
 		 1272 aa  186  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.851877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  21.71 
 
 		 1206 aa  183  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1192 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  21.63 
 
 		 1206 aa  180  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  32.87 
 
 		 1302 aa  180  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  30.31 
 
 		 1302 aa  179  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  29.23 
 
 		 1179 aa  179  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  23.71 
 
 		 1317 aa  172  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  21.35 
 
 		 1194 aa  168  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  34.04 
 
 		 1175 aa  161  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3247  ImcF domain-containing protein  24.55 
 
 		 1114 aa  159  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2591  ImcF domain-containing protein  24.72 
 
 		 1140 aa  159  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1168 aa  159  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0795  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1140 aa  159  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2989  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1140 aa  158  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000392845 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2495  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1140 aa  157  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.963407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1205  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1134 aa  157  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  28.08 
 
 		 1268 aa  155  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>