161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2881 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  45.03 
 
 		 1181 aa  949    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  44.42 
 
 		 1204 aa  869    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  100 
 
 		 1148 aa  2307    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  35.11 
 
 		 1176 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  35.47 
 
 		 1102 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  35.48 
 
 		 1175 aa  531  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  33.62 
 
 		 1171 aa  526  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  32.18 
 
 		 1199 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  32.41 
 
 		 1211 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  31.75 
 
 		 1209 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  33.12 
 
 		 1220 aa  480  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  31.99 
 
 		 1212 aa  479  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  29.52 
 
 		 1182 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  30.84 
 
 		 1209 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  30.84 
 
 		 1209 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  30.84 
 
 		 1209 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  30.84 
 
 		 1209 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  30.84 
 
 		 1209 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  30.84 
 
 		 1209 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  30.95 
 
 		 1218 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  30.76 
 
 		 1209 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  30.27 
 
 		 1209 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  31.96 
 
 		 1152 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1205 aa  449  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  29.41 
 
 		 1172 aa  445  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1181 aa  446  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1208 aa  439  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  29.38 
 
 		 1207 aa  428  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  29.98 
 
 		 1164 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  30.64 
 
 		 1157 aa  406  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  30.92 
 
 		 1176 aa  399  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  28.97 
 
 		 1179 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1179 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1192 aa  352  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  28.68 
 
 		 1302 aa  343  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  28.46 
 
 		 1302 aa  342  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1175 aa  342  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  28.45 
 
 		 1302 aa  341  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  26.62 
 
 		 1302 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1168 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  28.48 
 
 		 1329 aa  337  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  26.98 
 
 		 1302 aa  331  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  28.86 
 
 		 1268 aa  330  8e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1175 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  28.74 
 
 		 1302 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  25.99 
 
 		 1182 aa  323  9.000000000000001e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  27.65 
 
 		 1348 aa  319  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1195 aa  296  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  23.91 
 
 		 1187 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  27.61 
 
 		 1230 aa  283  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  48.17 
 
 		 1173 aa  282  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  26.85 
 
 		 1289 aa  281  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  26.85 
 
 		 1289 aa  280  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  26.97 
 
 		 1289 aa  280  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  26.88 
 
 		 1289 aa  278  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  41.27 
 
 		 1173 aa  278  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  25.51 
 
 		 1275 aa  278  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1275 aa  278  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  28.42 
 
 		 1365 aa  273  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1369 aa  271  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  25.02 
 
 		 1194 aa  268  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  25.9 
 
 		 1177 aa  261  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  25.9 
 
 		 1177 aa  261  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  27.71 
 
 		 1365 aa  258  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1008 aa  258  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  26.52 
 
 		 1317 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1270 aa  247  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  25.08 
 
 		 1150 aa  246  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1332 aa  243  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1208 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  24.66 
 
 		 1288 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  29.68 
 
 		 1315 aa  235  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  27.36 
 
 		 1366 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  24.59 
 
 		 1194 aa  233  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1206 aa  231  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  39.11 
 
 		 1313 aa  229  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  24.07 
 
 		 1206 aa  228  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  31.62 
 
 		 1301 aa  226  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  28.85 
 
 		 1314 aa  224  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  28.85 
 
 		 1314 aa  224  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  28.85 
 
 		 1314 aa  224  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  31.42 
 
 		 1297 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  31.42 
 
 		 1297 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  29.38 
 
 		 1313 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  31.42 
 
 		 1297 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  31.42 
 
 		 1297 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  31.42 
 
 		 1297 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  31.42 
 
 		 1297 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  31.42 
 
 		 1297 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1164 aa  222  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  29.84 
 
 		 1313 aa  222  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  21.75 
 
 		 1164 aa  221  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  31.22 
 
 		 1315 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  25.19 
 
 		 1153 aa  219  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1153 aa  218  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  22.95 
 
 		 1165 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  23.36 
 
 		 1165 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  26.84 
 
 		 1358 aa  211  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  26.84 
 
 		 1358 aa  211  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1174 aa  211  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>