167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5418 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  58.98 
 
 		 1168 aa  1413    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  100 
 
 		 1192 aa  2432    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  84.39 
 
 		 1179 aa  2003    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  78.72 
 
 		 1175 aa  1824    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  78.64 
 
 		 1175 aa  1789    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  67.8 
 
 		 1179 aa  1556    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  30.35 
 
 		 1171 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1181 aa  479  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1176 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  28.72 
 
 		 1172 aa  469  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  29.43 
 
 		 1182 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  31.21 
 
 		 1102 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  29.08 
 
 		 1199 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  29.83 
 
 		 1209 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1205 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  29.83 
 
 		 1175 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  31.03 
 
 		 1220 aa  415  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  28.98 
 
 		 1209 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1208 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  28.81 
 
 		 1209 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  28.81 
 
 		 1209 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  28.72 
 
 		 1209 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  28.72 
 
 		 1209 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  28.72 
 
 		 1209 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  28.72 
 
 		 1209 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  28.37 
 
 		 1209 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  29.41 
 
 		 1176 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  27.15 
 
 		 1211 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  27.91 
 
 		 1212 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  30.23 
 
 		 1152 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1173 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  27.24 
 
 		 1218 aa  369  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  27.84 
 
 		 1181 aa  365  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  25 
 
 		 1182 aa  364  5.0000000000000005e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  26.97 
 
 		 1302 aa  363  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  27.33 
 
 		 1173 aa  361  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  26.89 
 
 		 1302 aa  360  7e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  26.54 
 
 		 1302 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  26.57 
 
 		 1164 aa  356  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  27.59 
 
 		 1148 aa  353  8e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  27.15 
 
 		 1302 aa  352  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  26.59 
 
 		 1207 aa  352  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  28.26 
 
 		 1157 aa  342  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  24.98 
 
 		 1187 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  26.14 
 
 		 1177 aa  331  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  26.14 
 
 		 1177 aa  331  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 1194 aa  324  5e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  26.25 
 
 		 1302 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  28.23 
 
 		 1194 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  28.25 
 
 		 1204 aa  320  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  26.16 
 
 		 1302 aa  313  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  26.58 
 
 		 1268 aa  312  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1206 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  26.8 
 
 		 1206 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  24.98 
 
 		 1195 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  26.67 
 
 		 1329 aa  304  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1208 aa  300  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1008 aa  299  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  24.71 
 
 		 1165 aa  295  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  25 
 
 		 1165 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  24.83 
 
 		 1165 aa  289  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  25.33 
 
 		 1365 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  26.19 
 
 		 1289 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  26.27 
 
 		 1289 aa  283  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  26.31 
 
 		 1289 aa  281  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  25.23 
 
 		 1348 aa  280  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1174 aa  280  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  25.69 
 
 		 1153 aa  278  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  25.34 
 
 		 1317 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1174 aa  276  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  26.03 
 
 		 1289 aa  276  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1153 aa  275  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1275 aa  272  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  24.8 
 
 		 1275 aa  272  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  26.48 
 
 		 1205 aa  271  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1332 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000435  IcmF-related protein  24.42 
 
 		 1130 aa  254  9.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.127342  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05857  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1129 aa  250  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1369 aa  250  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  26.29 
 
 		 1365 aa  243  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  24.75 
 
 		 1150 aa  235  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1270 aa  234  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  26.38 
 
 		 1366 aa  231  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  23.51 
 
 		 1288 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  26.76 
 
 		 1358 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  26.67 
 
 		 1358 aa  222  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  26.67 
 
 		 1358 aa  221  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  23.56 
 
 		 1230 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  29.76 
 
 		 830 aa  213  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  30.86 
 
 		 1301 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1297 aa  201  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1297 aa  201  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1297 aa  201  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1297 aa  201  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1297 aa  201  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1297 aa  201  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1297 aa  201  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  31.13 
 
 		 1315 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1315 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  31.41 
 
 		 1313 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>