159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0934 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  71.22 
 
 		 1348 aa  1865    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  45.65 
 
 		 1289 aa  1030    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  42.6 
 
 		 1302 aa  1020    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  45.58 
 
 		 1289 aa  1026    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  100 
 
 		 1329 aa  2690    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  44.59 
 
 		 1302 aa  1074    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  66 
 
 		 1358 aa  1639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  67.69 
 
 		 1369 aa  1825    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  56.21 
 
 		 1332 aa  1359    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  44.33 
 
 		 1302 aa  1061    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  34.49 
 
 		 1209 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  70.05 
 
 		 1365 aa  1834    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  48.09 
 
 		 1268 aa  1180    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  34.9 
 
 		 1211 aa  674    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  68.22 
 
 		 1365 aa  1811    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  43 
 
 		 1302 aa  1033    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0928  SciS protein  60.53 
 
 		 890 aa  894    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0929  SciS protein  75.24 
 
 		 431 aa  648    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  52.64 
 
 		 1317 aa  1281    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1215  ImcF-like family protein  60.53 
 
 		 890 aa  894    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1216  hypothetical protein  75.24 
 
 		 431 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  44.73 
 
 		 1302 aa  1075    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  65.85 
 
 		 1358 aa  1638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  44.66 
 
 		 1302 aa  1076    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  65.7 
 
 		 1358 aa  1632    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  67.58 
 
 		 1366 aa  1775    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  45.8 
 
 		 1289 aa  1031    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  45.65 
 
 		 1289 aa  1033    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  34.67 
 
 		 1208 aa  632  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  34.17 
 
 		 1209 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  34.17 
 
 		 1209 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  34.17 
 
 		 1209 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  34.17 
 
 		 1209 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  34.17 
 
 		 1209 aa  622  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  34.17 
 
 		 1209 aa  622  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  34.01 
 
 		 1209 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1205 aa  608  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  33.18 
 
 		 1209 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  30.18 
 
 		 1275 aa  592  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1275 aa  592  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  32.07 
 
 		 1199 aa  589  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  32.39 
 
 		 1218 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  33.54 
 
 		 1220 aa  547  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  30.53 
 
 		 1150 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  29.65 
 
 		 1212 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  30.14 
 
 		 1207 aa  498  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  28.6 
 
 		 1171 aa  485  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1176 aa  483  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1102 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  25.9 
 
 		 1172 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  26.89 
 
 		 1182 aa  395  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1181 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  28.22 
 
 		 1181 aa  373  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1173 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  29.42 
 
 		 1204 aa  360  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  26.82 
 
 		 1164 aa  359  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  28.04 
 
 		 1173 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  27.92 
 
 		 1148 aa  315  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  24.44 
 
 		 1187 aa  291  6e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  26.91 
 
 		 1157 aa  289  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1192 aa  281  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  27.02 
 
 		 1152 aa  278  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  30.76 
 
 		 1175 aa  278  6e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1179 aa  275  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  23.94 
 
 		 1182 aa  274  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1168 aa  258  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1208 aa  251  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1008 aa  250  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  25.7 
 
 		 1179 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  23.45 
 
 		 1206 aa  227  9e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 1194 aa  226  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  24.92 
 
 		 1288 aa  225  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1297 aa  224  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1297 aa  224  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1297 aa  224  9e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1297 aa  224  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1297 aa  224  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  35.02 
 
 		 1176 aa  223  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1297 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1297 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1164 aa  223  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  26.25 
 
 		 1164 aa  223  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1206 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  23.84 
 
 		 1194 aa  219  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  23 
 
 		 1177 aa  219  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  23 
 
 		 1177 aa  219  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  22.23 
 
 		 1270 aa  213  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1167 aa  207  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1167 aa  207  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1104 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  25.49 
 
 		 1164 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0730  hypothetical protein  26.68 
 
 		 728 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000967191  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  23.24 
 
 		 1165 aa  202  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  23.6 
 
 		 1230 aa  190  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1174 aa  189  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1313 aa  189  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1195 aa  188  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1174 aa  187  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  30.27 
 
 		 1301 aa  186  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  21.89 
 
 		 1165 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>