162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2188 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  55.37 
 
 		 1313 aa  1367    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  54.19 
 
 		 1297 aa  1400    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  100 
 
 		 1270 aa  2594    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  54.11 
 
 		 1297 aa  1398    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  55.54 
 
 		 1288 aa  1421    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  53.22 
 
 		 1315 aa  1391    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  53.19 
 
 		 1315 aa  1421    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  54.35 
 
 		 1301 aa  1392    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  53.5 
 
 		 1314 aa  1402    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  53.55 
 
 		 1313 aa  1395    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  53.5 
 
 		 1314 aa  1402    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  53.17 
 
 		 1313 aa  1397    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  48.28 
 
 		 1230 aa  1178    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  54.19 
 
 		 1297 aa  1400    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  53.5 
 
 		 1314 aa  1402    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  54.19 
 
 		 1297 aa  1400    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  54.23 
 
 		 1297 aa  1400    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  54.19 
 
 		 1297 aa  1399    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  54.19 
 
 		 1297 aa  1400    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2501  type VI secretion protein IcmF  27.24 
 
 		 1268 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.761474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3091  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1267 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2631  ImcF domain-containing protein  27.85 
 
 		 1267 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2773  type VI secretion protein IcmF  27.02 
 
 		 1265 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.276817  normal  0.540963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1195 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1176 aa  353  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1102 aa  349  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  31.93 
 
 		 831 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  32.27 
 
 		 831 aa  328  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1205 aa  324  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  31.88 
 
 		 831 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  31.88 
 
 		 831 aa  322  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  27.33 
 
 		 1199 aa  318  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  26.45 
 
 		 1211 aa  314  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  29.94 
 
 		 830 aa  307  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  25.11 
 
 		 1182 aa  305  4.0000000000000003e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  28.88 
 
 		 1209 aa  304  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  28.88 
 
 		 1209 aa  304  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  24.6 
 
 		 1172 aa  304  7.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  28.88 
 
 		 1209 aa  304  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  28.88 
 
 		 1209 aa  303  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  28.88 
 
 		 1209 aa  303  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  28.88 
 
 		 1209 aa  303  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  28.88 
 
 		 1209 aa  303  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  27.32 
 
 		 1171 aa  302  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  27.4 
 
 		 1209 aa  301  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  32.09 
 
 		 830 aa  300  9e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1208 aa  290  9e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  25.96 
 
 		 1207 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  25.75 
 
 		 1212 aa  284  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  27.05 
 
 		 1220 aa  280  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  30.58 
 
 		 1218 aa  276  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  25.61 
 
 		 1209 aa  266  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1181 aa  260  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  26.2 
 
 		 1181 aa  258  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  27.54 
 
 		 1164 aa  256  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  28.98 
 
 		 1302 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  29.47 
 
 		 1302 aa  248  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  29.35 
 
 		 1302 aa  247  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  27.56 
 
 		 1152 aa  244  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  26.04 
 
 		 1302 aa  241  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  31.69 
 
 		 1335 aa  239  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  25.07 
 
 		 1148 aa  239  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4962  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1310 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  39.35 
 
 		 1173 aa  233  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1179 aa  231  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  39.64 
 
 		 1173 aa  230  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  26.33 
 
 		 1157 aa  229  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  39.4 
 
 		 1176 aa  220  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  28.31 
 
 		 1302 aa  220  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  31.72 
 
 		 1204 aa  220  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  22.36 
 
 		 1329 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1192 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1168 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1175 aa  212  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  22.3 
 
 		 1206 aa  211  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1206 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  21.81 
 
 		 1187 aa  207  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0274  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1154 aa  203  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  27.25 
 
 		 1302 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0018  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1204 aa  201  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  32.63 
 
 		 1289 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  32.63 
 
 		 1289 aa  201  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  22.47 
 
 		 1194 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  32.63 
 
 		 1289 aa  200  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  32.39 
 
 		 1289 aa  199  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  33.93 
 
 		 1175 aa  197  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  26.16 
 
 		 1179 aa  197  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  23.09 
 
 		 1182 aa  197  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0633  ImcF-like protein  26.19 
 
 		 1115 aa  196  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.201654 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  25.93 
 
 		 1150 aa  196  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1275 aa  193  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  25.65 
 
 		 1275 aa  193  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3166  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1150 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5271  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1156 aa  192  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1208 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0163  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1147 aa  186  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.137975  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  22.37 
 
 		 1177 aa  185  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  22.37 
 
 		 1177 aa  185  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  22.14 
 
 		 1165 aa  183  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  21.96 
 
 		 1165 aa  181  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>