149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3166 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3166  hypothetical protein  100 
 
 		 1150 aa  2324    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0274  hypothetical protein  69.44 
 
 		 1154 aa  1632    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3045  hypothetical protein  41.28 
 
 		 1133 aa  813    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1205  hypothetical protein  41.09 
 
 		 1134 aa  819    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0855  putative lipoprotein  30.99 
 
 		 1296 aa  426  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0883646  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0729.1  hypothetical protein  37.15 
 
 		 1525 aa  257  7e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0619  hypothetical protein  37.15 
 
 		 1355 aa  257  7e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.104026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0730  hypothetical protein  37.15 
 
 		 1322 aa  257  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224461  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1688  hypothetical protein  37.15 
 
 		 1319 aa  257  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0549  hypothetical protein  37.15 
 
 		 1299 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2040  hypothetical protein  37.15 
 
 		 1334 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2138  hypothetical protein  36.75 
 
 		 1328 aa  252  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0017  hypothetical protein  22.1 
 
 		 1140 aa  247  9e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  32.51 
 
 		 1195 aa  209  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  30.1 
 
 		 1301 aa  201  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  33.2 
 
 		 1171 aa  201  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  31.63 
 
 		 831 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1297 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1297 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  30.24 
 
 		 1315 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1297 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1297 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1297 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1297 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1297 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  29.79 
 
 		 1313 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  30.44 
 
 		 1230 aa  200  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  29.79 
 
 		 1313 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  31.27 
 
 		 831 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  30.98 
 
 		 1315 aa  197  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  30.78 
 
 		 1270 aa  196  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  31.19 
 
 		 831 aa  196  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  33.19 
 
 		 1176 aa  195  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  30.31 
 
 		 1314 aa  194  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  30.31 
 
 		 1314 aa  194  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  30.31 
 
 		 1314 aa  194  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1102 aa  191  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  30.41 
 
 		 1288 aa  190  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 		 831 aa  187  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  36.01 
 
 		 1204 aa  178  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1205 aa  177  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  29.72 
 
 		 830 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  28.38 
 
 		 830 aa  177  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  31.92 
 
 		 1220 aa  176  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  32.68 
 
 		 1313 aa  174  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  30.67 
 
 		 1172 aa  173  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  30.43 
 
 		 1152 aa  174  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  29.23 
 
 		 1218 aa  173  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  31.88 
 
 		 1207 aa  170  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  28.9 
 
 		 1209 aa  169  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  27.05 
 
 		 1199 aa  168  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  34.37 
 
 		 1212 aa  167  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  31.23 
 
 		 1181 aa  164  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1181 aa  164  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  29.09 
 
 		 1182 aa  163  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1208 aa  160  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  29.32 
 
 		 1157 aa  159  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  36.59 
 
 		 1211 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  33.15 
 
 		 1176 aa  157  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  36.7 
 
 		 1173 aa  156  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  30.77 
 
 		 1164 aa  156  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  28.54 
 
 		 1209 aa  156  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  28.54 
 
 		 1209 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  28.54 
 
 		 1209 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  28.54 
 
 		 1209 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  28.54 
 
 		 1209 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  32.39 
 
 		 1302 aa  155  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  32.39 
 
 		 1302 aa  154  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  35.47 
 
 		 1173 aa  154  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  27.92 
 
 		 1209 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  27.92 
 
 		 1209 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  27.92 
 
 		 1209 aa  154  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  32.39 
 
 		 1302 aa  154  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  33.49 
 
 		 1175 aa  152  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4962  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1310 aa  149  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  32.58 
 
 		 1302 aa  149  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  28.54 
 
 		 1179 aa  147  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  34.1 
 
 		 1289 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  32.94 
 
 		 1148 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  34.1 
 
 		 1289 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  33.53 
 
 		 1289 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  34.1 
 
 		 1289 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1192 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1179 aa  137  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  29.33 
 
 		 1335 aa  137  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2501  type VI secretion protein IcmF  28.57 
 
 		 1268 aa  136  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.761474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  33.92 
 
 		 1302 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2773  type VI secretion protein IcmF  27.1 
 
 		 1265 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.276817  normal  0.540963 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  33.82 
 
 		 1302 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1168 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2631  ImcF domain-containing protein  26.77 
 
 		 1267 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3091  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1267 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1175 aa  126  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1175 aa  126  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  27.55 
 
 		 1329 aa  125  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  24.48 
 
 		 1182 aa  118  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  25.97 
 
 		 1165 aa  118  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 1194 aa  114  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  27.87 
 
 		 1165 aa  114  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  25.6 
 
 		 1165 aa  112  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>