148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0730 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0729.1  hypothetical protein  99.85 
 
 
1525 aa  1210    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0549  hypothetical protein  97.69 
 
 
1299 aa  2145    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553275  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0855  putative lipoprotein  79.34 
 
 
1296 aa  1829    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0883646  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0619  hypothetical protein  100 
 
 
1355 aa  1211    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.104026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0730  hypothetical protein  100 
 
 
1322 aa  2534    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224461  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2138  hypothetical protein  99.7 
 
 
1328 aa  1211    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2040  hypothetical protein  99.85 
 
 
1334 aa  1207    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1688  hypothetical protein  99.47 
 
 
1319 aa  2210    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0274  hypothetical protein  32.89 
 
 
1154 aa  278  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3166  hypothetical protein  37.88 
 
 
1150 aa  275  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3045  hypothetical protein  31.46 
 
 
1133 aa  211  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1205  hypothetical protein  31.44 
 
 
1134 aa  210  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  34.71 
 
 
1176 aa  158  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  34.51 
 
 
1181 aa  157  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  36.04 
 
 
1102 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  31.41 
 
 
1212 aa  153  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  27.15 
 
 
1195 aa  152  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  27.35 
 
 
1172 aa  152  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  33.63 
 
 
1207 aa  149  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  33.95 
 
 
1218 aa  147  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  28.19 
 
 
1270 aa  145  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  31.26 
 
 
1171 aa  145  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  32.57 
 
 
1176 aa  144  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  26.57 
 
 
1315 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  34.58 
 
 
1152 aa  144  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  35.1 
 
 
1204 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  27.27 
 
 
1297 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  27.27 
 
 
1297 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  27.27 
 
 
1297 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  27.27 
 
 
1301 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  27.27 
 
 
1297 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  27.27 
 
 
1297 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  27.27 
 
 
1297 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  27.27 
 
 
1297 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  30.72 
 
 
1230 aa  142  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  28.49 
 
 
1181 aa  141  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  37.17 
 
 
1220 aa  141  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  28.49 
 
 
1182 aa  140  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  32.33 
 
 
1209 aa  140  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  29.56 
 
 
1313 aa  139  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  34.32 
 
 
1173 aa  139  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  26.03 
 
 
1288 aa  139  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  27.82 
 
 
1315 aa  139  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0017  hypothetical protein  22.48 
 
 
1140 aa  137  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075528  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  32.78 
 
 
1205 aa  137  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  27.53 
 
 
1314 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  27.76 
 
 
1313 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  27.53 
 
 
1314 aa  136  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  27.76 
 
 
1313 aa  136  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  27.53 
 
 
1314 aa  136  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  33.97 
 
 
1199 aa  135  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  33.83 
 
 
1173 aa  135  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  31.79 
 
 
1148 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  34.81 
 
 
1211 aa  131  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  31.65 
 
 
1208 aa  129  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  33.71 
 
 
1209 aa  128  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  33.84 
 
 
1209 aa  127  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  33.84 
 
 
1209 aa  127  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  33.84 
 
 
1209 aa  127  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  33.84 
 
 
1209 aa  127  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  33.84 
 
 
1209 aa  127  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  33.84 
 
 
1209 aa  127  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  33.84 
 
 
1209 aa  127  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  32.07 
 
 
1179 aa  124  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  28.8 
 
 
1192 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  29.37 
 
 
831 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  29.37 
 
 
831 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  28.52 
 
 
1182 aa  118  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  28.35 
 
 
1168 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  29 
 
 
1164 aa  117  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  28.33 
 
 
831 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4962  hypothetical protein  28.79 
 
 
1310 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  31.59 
 
 
1302 aa  116  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  29.04 
 
 
831 aa  116  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  30.68 
 
 
830 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  31.34 
 
 
1175 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  31.34 
 
 
1175 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  27.84 
 
 
1179 aa  115  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  31.68 
 
 
1302 aa  115  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  31.68 
 
 
1302 aa  115  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  31.3 
 
 
1194 aa  113  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  31.77 
 
 
1206 aa  113  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  28.18 
 
 
1157 aa  111  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  31.07 
 
 
1206 aa  111  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  29.17 
 
 
830 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  28.86 
 
 
1329 aa  110  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  34.24 
 
 
1175 aa  110  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  34.42 
 
 
1302 aa  108  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  28.29 
 
 
1275 aa  108  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  28.29 
 
 
1275 aa  108  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  26.75 
 
 
1150 aa  108  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  25.69 
 
 
1187 aa  107  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  31.97 
 
 
1302 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  37.21 
 
 
1302 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  31.02 
 
 
1194 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  26.85 
 
 
1335 aa  103  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2631  ImcF domain-containing protein  28.03 
 
 
1267 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390277  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  27.93 
 
 
1208 aa  102  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2501  type VI secretion protein IcmF  27.36 
 
 
1268 aa  102  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.761474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3091  hypothetical protein  27.99 
 
 
1267 aa  101  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.986291 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>