166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3000 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  37.87 
 
 		 1220 aa  736    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  44.79 
 
 		 1211 aa  1011    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  45.65 
 
 		 1209 aa  1008    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  42.76 
 
 		 1205 aa  950    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  38.02 
 
 		 1218 aa  759    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  100 
 
 		 1212 aa  2489    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  45.73 
 
 		 1209 aa  1009    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  44.63 
 
 		 1208 aa  1008    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  45.11 
 
 		 1209 aa  1009    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  39.53 
 
 		 1199 aa  800    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  37.9 
 
 		 1102 aa  701    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  39.09 
 
 		 1209 aa  826    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  45.65 
 
 		 1209 aa  1008    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  45.65 
 
 		 1209 aa  1008    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  45.73 
 
 		 1209 aa  1010    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  45.73 
 
 		 1209 aa  1010    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  45.65 
 
 		 1209 aa  1008    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  60.25 
 
 		 1207 aa  1505    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  37.15 
 
 		 1171 aa  695    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  38.05 
 
 		 1176 aa  742    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  31.44 
 
 		 1172 aa  581  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  32.02 
 
 		 1302 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  32.09 
 
 		 1302 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  31.94 
 
 		 1302 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  32.25 
 
 		 1302 aa  551  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  31.79 
 
 		 1302 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  29.82 
 
 		 1329 aa  525  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  29.47 
 
 		 1182 aa  522  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  31.06 
 
 		 1302 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  32.19 
 
 		 1289 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  30.27 
 
 		 1181 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1181 aa  506  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  29.68 
 
 		 1268 aa  505  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  32.11 
 
 		 1289 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  32.19 
 
 		 1289 aa  502  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  28.5 
 
 		 1348 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  32.11 
 
 		 1289 aa  499  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  32.62 
 
 		 1204 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  31.39 
 
 		 1365 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  30.36 
 
 		 1175 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  31.78 
 
 		 1148 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  30.57 
 
 		 1365 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  28.93 
 
 		 1164 aa  448  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  30.53 
 
 		 1176 aa  449  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  30.99 
 
 		 1358 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  30.99 
 
 		 1358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  30.91 
 
 		 1358 aa  446  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1369 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1173 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  28.55 
 
 		 1275 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  28.55 
 
 		 1275 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1332 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  30.19 
 
 		 1366 aa  412  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  29.9 
 
 		 1173 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  29.72 
 
 		 1152 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  29.03 
 
 		 1157 aa  406  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  27.58 
 
 		 1317 aa  393  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  28.4 
 
 		 1150 aa  375  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  26.35 
 
 		 1164 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1164 aa  373  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1192 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  27.16 
 
 		 1187 aa  349  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  27.32 
 
 		 1179 aa  348  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1195 aa  334  5e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  25.95 
 
 		 1182 aa  330  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1175 aa  327  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1168 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1179 aa  325  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1175 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  25.06 
 
 		 1288 aa  317  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1208 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  24.25 
 
 		 1164 aa  303  9e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 1194 aa  302  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1008 aa  302  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1167 aa  300  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1167 aa  300  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1167 aa  298  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1167 aa  298  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  25.16 
 
 		 1165 aa  296  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  25.79 
 
 		 1165 aa  295  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  26.88 
 
 		 1205 aa  293  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  25.3 
 
 		 1177 aa  291  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  25.3 
 
 		 1177 aa  291  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1270 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  25.04 
 
 		 1165 aa  290  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1297 aa  289  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  26.08 
 
 		 1206 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1297 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1147 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1297 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1297 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1297 aa  289  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1297 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1206 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  25.93 
 
 		 1194 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  25.95 
 
 		 1301 aa  284  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1297 aa  284  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1104 aa  271  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1315 aa  266  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0928  SciS protein  31.48 
 
 		 890 aa  265  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>