168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1473 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  42.47 
 
 		 1209 aa  937    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  42.38 
 
 		 1209 aa  931    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  37.13 
 
 		 1207 aa  768    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  41.94 
 
 		 1208 aa  936    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  42.88 
 
 		 1209 aa  944    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  39.23 
 
 		 1102 aa  762    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  100 
 
 		 1209 aa  2452    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  71.64 
 
 		 1218 aa  1715    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  42.47 
 
 		 1209 aa  937    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  43.6 
 
 		 1205 aa  899    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  42.47 
 
 		 1209 aa  937    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  39.1 
 
 		 1176 aa  805    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  44.28 
 
 		 1211 aa  978    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  42.47 
 
 		 1209 aa  937    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  42.58 
 
 		 1199 aa  879    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  42.47 
 
 		 1209 aa  937    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  42.47 
 
 		 1209 aa  937    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  39.09 
 
 		 1212 aa  840    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  39.65 
 
 		 1171 aa  783    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  42.1 
 
 		 1220 aa  835    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  33.73 
 
 		 1302 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  33.73 
 
 		 1302 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  33.65 
 
 		 1302 aa  632  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  33.73 
 
 		 1302 aa  628  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  33.46 
 
 		 1302 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  31.99 
 
 		 1302 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  33.54 
 
 		 1329 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  33.57 
 
 		 1268 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  33.57 
 
 		 1348 aa  602  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  32.21 
 
 		 1182 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  31.55 
 
 		 1172 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  32.78 
 
 		 1289 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  32.38 
 
 		 1289 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  32.54 
 
 		 1289 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  32.54 
 
 		 1289 aa  562  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  33.36 
 
 		 1176 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  31.74 
 
 		 1164 aa  526  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  33.2 
 
 		 1175 aa  524  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  30.79 
 
 		 1181 aa  514  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1181 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  34.03 
 
 		 1365 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  33.78 
 
 		 1365 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  32.89 
 
 		 1369 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  33.75 
 
 		 1358 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  33.69 
 
 		 1366 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  33.85 
 
 		 1358 aa  486  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  33.85 
 
 		 1358 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  34.14 
 
 		 1204 aa  481  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  31.67 
 
 		 1148 aa  475  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1332 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  32.93 
 
 		 1152 aa  462  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  29.95 
 
 		 1317 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  30.63 
 
 		 1173 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1173 aa  459  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1275 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  28.71 
 
 		 1275 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1192 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  29.64 
 
 		 1179 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1179 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  28.97 
 
 		 1150 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  25.29 
 
 		 1164 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  26.53 
 
 		 1182 aa  379  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1164 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1175 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  32.48 
 
 		 1157 aa  369  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1175 aa  364  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  25.24 
 
 		 1187 aa  362  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1195 aa  351  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1168 aa  348  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 1194 aa  315  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1008 aa  312  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  24.86 
 
 		 1165 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1206 aa  295  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  25.34 
 
 		 1165 aa  294  9e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1208 aa  293  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  25.69 
 
 		 1288 aa  292  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  25.09 
 
 		 1165 aa  291  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  25.98 
 
 		 1194 aa  287  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  25.47 
 
 		 1206 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  25.58 
 
 		 1177 aa  284  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  25.58 
 
 		 1177 aa  284  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  26.96 
 
 		 1230 aa  278  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1297 aa  278  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1297 aa  277  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1297 aa  277  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1297 aa  277  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1297 aa  277  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1297 aa  277  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1297 aa  277  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  25.46 
 
 		 1301 aa  277  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1270 aa  273  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1315 aa  267  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0928  SciS protein  35 
 
 		 890 aa  266  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1215  ImcF-like family protein  35 
 
 		 890 aa  266  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  25.74 
 
 		 1205 aa  260  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  31.89 
 
 		 1313 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  31.83 
 
 		 1314 aa  254  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  31.83 
 
 		 1314 aa  254  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  31.83 
 
 		 1314 aa  254  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  35.5 
 
 		 1313 aa  254  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>