166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3182 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  52.64 
 
 		 1329 aa  1299    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  39.49 
 
 		 1289 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  39.51 
 
 		 1289 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  39.34 
 
 		 1289 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  100 
 
 		 1317 aa  2644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  39.27 
 
 		 1302 aa  832    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  39.82 
 
 		 1302 aa  859    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  52.17 
 
 		 1358 aa  1211    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  54.29 
 
 		 1369 aa  1363    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  73.55 
 
 		 1332 aa  1858    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  39.66 
 
 		 1302 aa  847    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  52.39 
 
 		 1365 aa  1306    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  41.3 
 
 		 1268 aa  917    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  55.07 
 
 		 1365 aa  1367    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  54.3 
 
 		 1366 aa  1333    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  39.75 
 
 		 1302 aa  858    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  52.24 
 
 		 1358 aa  1212    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  39.67 
 
 		 1302 aa  857    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  52.17 
 
 		 1358 aa  1211    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  52.66 
 
 		 1348 aa  1294    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  38.53 
 
 		 1302 aa  835    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  39.56 
 
 		 1289 aa  798    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0929  SciS protein  65.49 
 
 		 431 aa  579  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1216  hypothetical protein  65.49 
 
 		 431 aa  579  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  31.01 
 
 		 1211 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0928  SciS protein  45.06 
 
 		 890 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1215  ImcF-like family protein  45.06 
 
 		 890 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  32.03 
 
 		 1209 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  32.46 
 
 		 1205 aa  512  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  32.44 
 
 		 1208 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  32.53 
 
 		 1199 aa  505  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  31.53 
 
 		 1209 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  31.53 
 
 		 1209 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  31.53 
 
 		 1209 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  31.53 
 
 		 1209 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  31.53 
 
 		 1209 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  31.53 
 
 		 1209 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  31.45 
 
 		 1209 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  29.72 
 
 		 1209 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  33.01 
 
 		 1220 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  26.5 
 
 		 1275 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1275 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  29.22 
 
 		 1218 aa  449  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  27.54 
 
 		 1207 aa  412  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  27.81 
 
 		 1171 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  27.29 
 
 		 1212 aa  410  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  28.56 
 
 		 1176 aa  393  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  26.06 
 
 		 1150 aa  389  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  24.82 
 
 		 1172 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1102 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  25.14 
 
 		 1182 aa  346  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  28.1 
 
 		 1176 aa  317  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1181 aa  311  4e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  25.28 
 
 		 1164 aa  301  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  27.51 
 
 		 1204 aa  288  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  25.95 
 
 		 1181 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1173 aa  282  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1168 aa  281  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  27.98 
 
 		 1173 aa  272  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  24.36 
 
 		 1182 aa  268  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1179 aa  268  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1192 aa  266  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  26.14 
 
 		 1179 aa  264  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  25.23 
 
 		 1164 aa  258  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  27.98 
 
 		 1152 aa  254  7e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  26.19 
 
 		 1148 aa  249  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  26.28 
 
 		 1157 aa  247  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  23.14 
 
 		 1187 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1175 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1167 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1167 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1167 aa  241  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1167 aa  241  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1147 aa  237  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1104 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  29.01 
 
 		 1175 aa  234  6e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  28.5 
 
 		 1164 aa  226  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1164 aa  225  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  25 
 
 		 1208 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  23.77 
 
 		 1177 aa  216  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  23.77 
 
 		 1177 aa  216  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1008 aa  216  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1206 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  24.69 
 
 		 1206 aa  212  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 1194 aa  208  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1174 aa  200  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  23.6 
 
 		 1301 aa  199  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0730  hypothetical protein  27.11 
 
 		 728 aa  199  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000967191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1297 aa  199  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1174 aa  199  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1297 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1297 aa  198  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1297 aa  198  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1297 aa  198  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1297 aa  198  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1297 aa  198  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  24.5 
 
 		 1194 aa  198  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  23.78 
 
 		 1288 aa  196  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  23.38 
 
 		 1165 aa  193  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  23.53 
 
 		 1230 aa  190  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>