100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_58660 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_58660  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5138  hypothetical protein  92.09 
 
 		 278 aa  360  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0781  signaling modulator of AmpD, AmpE  61.51 
 
 		 277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0788  AmpE  59.56 
 
 		 277 aa  289  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689986  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0818  ampE protein  60.43 
 
 		 278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927721  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0951  ampE protein  58.09 
 
 		 278 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0824  signaling modulator of AmpD, AmpE  59.19 
 
 		 276 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12130  Inner membrane protein  57.65 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.567702  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0813  signaling modulator of AmpD, AmpE  59.19 
 
 		 276 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0790  signaling modulator of AmpD, AmpE  58.82 
 
 		 276 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4404  signaling modulator of AmpD, AmpE  59.56 
 
 		 276 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.154037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0877  signaling modulator of AmpD, AmpE  27.7 
 
 		 281 aa  92.4  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0027178  normal  0.0245194 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1520  hypothetical protein  29.8 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1463  hypothetical protein  29.41 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3348  regulatory protein AmpE  30.24 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0955  signaling modulator of AmpD, AmpE  30.51 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3858  regulatory protein AmpE  29.87 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015429 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0638  signaling modulator of AmpD, AmpE  30.17 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3915  regulatory protein AmpE  29.19 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.370917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4056  regulatory protein AmpE  29.19 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000497634  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3936  regulatory protein AmpE  29.19 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.501947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0422  regulatory protein AmpE  29.09 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0994  signaling modulator of AmpD, AmpE  33.33 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3699  signaling modulator of AmpD, AmpE  36.67 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3779  regulatory protein AmpE  27.06 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0873  signaling modulator of AmpD, AmpE  32.29 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.62468  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3419  regulatory protein AmpE  26.41 
 
 		 283 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0429  regulatory protein AmpE  27.22 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942425 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0417  regulatory protein AmpE  23.27 
 
 		 282 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1889  hypothetical protein  27.54 
 
 		 334 aa  53.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3350  cobalamin biosynthesis protein CbiB  28.27 
 
 		 328 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0424  regulatory protein AmpE  27.86 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0508582  normal  0.052266 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3571  regulatory protein AmpE  26.58 
 
 		 284 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0631  regulatory protein AmpE  29.78 
 
 		 284 aa  52.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3757  regulatory protein AmpE  28.83 
 
 		 284 aa  52.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  26.37 
 
 		 302 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0522  cobalamin biosynthesis protein CbiB  24.42 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  24.21 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02953  transmembrane protein  31.51 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2698  cobalamin biosynthesis protein CbiB  28.27 
 
 		 328 aa  50.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3433  regulatory protein AmpE  25 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483045  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0320  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.97 
 
 		 338 aa  49.7  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167497  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.29 
 
 		 302 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03227  regulatory protein AmpE  30.99 
 
 		 289 aa  48.9  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0544057  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3367  regulatory protein AmpE  28.38 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.470719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4188  CobD/CbiB family protein  26.01 
 
 		 312 aa  48.9  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1038  regulatory protein AmpE  28.38 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.363864 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3495  regulatory protein AmpE  28.38 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  26.07 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1857  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.21 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0373  regulatory protein AmpE  25.99 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490103  hitchhiker  0.0000919241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  27.06 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1109  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  27.66 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0595  CobD/CbiB family protein  26.91 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  35.96 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1478  cobalamin biosynthesis protein CbiB  25.74 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1033  CobD/CbiB family protein  26.91 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1074  CobD/CbiB family protein  26.91 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0317  regulatory protein AmpE  21.21 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.810004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2660  CobD/CbiB family protein  30.61 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.95909  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0954  CobD/CbiB family protein  25.56 
 
 		 312 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2229  CobD/CbiB family protein  26.01 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2578  CobD/CbiB family protein  24.11 
 
 		 326 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0950  CobD/CbiB family protein  25.56 
 
 		 312 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0670  regulatory protein AmpE  26.47 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0568  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000159703  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1279  cobalamin biosynthesis protein CbiB  23.64 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00447148  normal  0.925435 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1615  beta-lactamase induction protein  33.33 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0562539  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3601  regulatory protein AmpE  26.94 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  28.57 
 
 		 313 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0426  regulatory protein AmpE  26.94 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  32.65 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1994  CobD/CbiB family protein  34.57 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0903  CobD/CbiB family protein  24.19 
 
 		 331 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  25.73 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0655  regulatory protein AmpE  26.67 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  28.03 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  25.68 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2912  CobD/CbiB family protein  34.18 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0396  CobD/CbiB family protein  34.18 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0206694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2962  CobD/CbiB family protein  34.18 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1666  CobD/CbiB family protein  31.82 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.805294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0235  CobD/CbiB family protein  34.18 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2852  CobD/CbiB family protein  34.18 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0912  CobD/CbiB family protein  34.18 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2539  CobD/CbiB family protein  34.18 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  25.57 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3385  regulatory protein AmpE  26.02 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1695  hypothetical protein  26.1 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.93045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0774  CobD/CbiB family protein  29.58 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1407  hypothetical protein  31.68 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.909593  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2432  adenosylcobinamide-phosphate synthase  29 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0111605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  29.27 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  27.78 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0780  regulatory protein AmpE  26.24 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.29134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  27.39 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  27.97 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5340  cobalamin biosynthesis protein CbiB  25.53 
 
 		 336 aa  42.7  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3023  CobD/CbiB family protein  28.7 
 
 		 307 aa  42  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.473012  normal  0.958188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0686  putative cobalamin biosynthesis transmembrane protein  26.59 
 
 		 329 aa  42  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.910501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>